taxreturn
v0.1
Taxreturn — это пакет R для извлечения последовательностей штрих-кодов ДНК и связанных с ними таксономических аннотаций из общедоступных баз данных, таких как база данных Barcode of Life (BOLD) и NCBI GenBank, обработки этих последовательностей и форматирования их в обучающие наборы, совместимые с популярными таксономическими классификаторами, используемыми для метабаркодирования и маркеров. генный анализ.
Этот пакет все еще находится в разработке и еще не доступен в CRAN. Вы можете установить версию для разработки с GitHub с помощью:
install.packages( " devtools " )
devtools :: install_github( " alexpiper/taxreturn " )
library( taxreturn )
Веб-сайт пакета содержит документацию по функциям и пример пошагового руководства.