lyprox
1.0.0
Это веб-приложение Django, которое отображает подробные закономерности лимфатических метастазов при раке головы и шеи и позволяет более подробно изучить базовые наборы данных. Он размещен по URL-адресу https://lyprox.org.
HNSCC распространяется по лимфатической системе шеи и образует метастазы в регионарные лимфатические узлы. Макроскопические метастазы можно обнаружить с помощью таких методов визуализации, как МРТ, ПЭТ и КТ. Затем они последовательно включаются в целевой объем, когда лучевая терапия выбирается как часть лечения. Однако микроскопические метастазы слишком малы, чтобы их можно было диагностировать с помощью современных методов визуализации.
Чтобы объяснить это микроскопическое поражение, части лимфатической системы часто избирательно облучают, чтобы усилить контроль над опухолью. Какие части включить в этот факультативный клинический целевой том, в настоящее время решается на основе рекомендаций 1 2 3 4 . Они, в свою очередь, получены на основе сообщений о распространенности поражения на уровне лимфатических узлов (LNL), то есть доли пациентов, у которых были диагностированы метастазы в любом конкретном LNL, стратифицированных по локализации первичной опухоли. Рекомендуется включать ЛНЛ в плановый целевой объем, если у 10–15% пациентов выявлено участие на этом конкретном уровне.
Однако, несмотря на то , что в литературе сообщается о распространенности поражения 5,6 и общие пути оттока лимфы хорошо изучены, детальные закономерности прогрессирования HNSCC остаются плохо выраженными количественно. Мы считаем, что риск микроскопического поражения при ЛНЛ в значительной степени зависит от конкретного диагноза конкретного пациента, и, следовательно, его лечение может быть персонализированным, если лучше количественно определить характер прогрессирования.
С помощью интерфейса мы в первую очередь стремимся сделать наш извлеченный набор данных легко доступным. Визуализируя это в интерактивном режиме, можно очень быстро проверить или выдвинуть гипотезу относительно лимфатического распространения HNSCC. Будем надеяться, что это, в свою очередь, побудит других исследователей исследовать эти гипотезы, извлекать и делиться более подробной информацией.
Это, в свою очередь, позволит нам (или кому-либо еще) построить более точные и точные модели прогрессирования опухоли. Например, как предыдущая работа по использованию байесовских сетей для прогнозирования персонализированной вероятности участия 7 или наша недавняя публикация по этому вопросу с использованием скрытых марковских моделей и тем самым введением явного способа моделирования времени 8 .
Данные, визуализируемые в этом интерфейсе, хранятся в отдельном репозитории с открытым исходным кодом: lyDATA.
Мы также опубликовали статью о наборе данных и интерфейсе в журнале Radiotherapy & Oncology 9 , а препринт доступен на medRxiv 10 .
Мы также работаем над вероятностными моделями 7, 8 , которые могут предсказать лимфатическое распространение рака головы и шеи. Базовый код размещен в другом репозитории: лимфа.
Вы можете внести свой вклад в этот проект двумя способами:
Если вы хотите разместить свои данные самостоятельно или попробовать, как они выглядят в веб-приложении, не выполняя загрузку, следуйте этим инструкциям, чтобы запустить их на локальном компьютере.
Винсент Грегуар и другие, Выбор и определение целевых объемов лимфатических узлов при конформной лучевой терапии головы и шеи. Предложение по стандартизации терминологии и методики, основанное на хирургическом опыте , Лучевая терапия и онкология , вып. 56, стр. 135–150, 2000 г., doi: https://doi.org/10.1016/S0167-8140(00)00202-4. ↩
Винсент Грегуар, А. Эйсбрух, М. Хамуар и П. Левендаг, Предложение по разграничению узлового CTV в шейном отделе и послеоперационной шее , Лучевая терапия и онкология , том. 79, нет. 1, стр. 15–20, апрель 2006 г., doi: https://doi.org/10.1016/j.radonc.2006.03.009. ↩
Винсент Грегуар и др., Определение уровней шейных узлов при опухолях головы и шеи: обновление 2013 г. DAHANCA, EORTC, HKNPCSG, NCIC CTG, NCRI, RTOG, консенсусные рекомендации TROG , Лучевая терапия и онкология , том. 110, нет. 1, стр. 172–181, январь 2014 г., doi: https://doi.org/10.1016/j.radonc.2013.10.010. ↩
Джулиан Биау и др., Выбор целевых объемов лимфатических узлов для окончательной лучевой терапии головы и шеи: обновление 2019 г. , Лучевая терапия и онкология , том. 134, стр. 1–9, май 2019 г., doi: https://doi.org/10.1016/j.radonc.2019.01.018. ↩
Джатин. П. Шах, Ф.К. Кандела и А.К. Поддар, Характеристика метастазов в шейные лимфатические узлы плоскоклеточного рака полости рта , Рак , том. 66, нет. 1, стр. 109–113, 1990, doi: https://doi.org/10.1002/1097-0142(19900701)66:1%3C109::AID-CNCR2820660120%3E3.0.CO;2-A. ↩
Лоуренс Баувенс и др., Распространенность и распределение метастазов в шейных лимфатических узлах при ВПЧ-положительной и ВПЧ-отрицательной плоскоклеточной карциноме ротоглотки , Лучевая терапия и онкология , том. 157, стр. 122–129, апрель 2021 г., doi: https://doi.org/10.1016/j.radonc.2021.01.028. ↩
Бертран Пуимайу, П. Балермпас, О. Ристерер, М. Гукенбергер и Дж. Ункельбах, Байесовская сетевая модель прогрессирования лимфатической опухоли для персонализированного выборочного определения CTV при раке головы и шеи , Physics in Medicine & Biology , vol. 64, нет. 16, с. 165003, август 2019 г., doi: https://doi.org/10.1088/1361-6560/ab2a18. ↩ ↩ 2
Роман Людвиг, Б. Пуймаю, П. Балермпас и Дж. Ункельбах, Скрытая марковская модель прогрессирования лимфатических опухолей головы и шеи , Sci Rep , vol. 11, нет. 1, с. 12261, декабрь 2021 г., doi: https://doi.org/10.1038/s41598-021-91544-1. ↩ ↩ 2
Роман Людвиг и др., Подробное индивидуальное сообщение пациента о вовлечении лимфатических узлов при плоскоклеточном раке ротоглотки с онлайн-интерфейсом , Радиотерапия и онкология , февраль 2022 г., doi: https://doi.org/10.1016/j.radonc.2022.01 .035. ↩
Роман Людвиг, Ж.-М. Хоффманн, Б. Пуимайу и др., Подробное индивидуальное сообщение пациента о вовлечении лимфатических узлов при плоскоклеточном раке ротоглотки с онлайн-интерфейсом , medRxiv , декабрь 2021 г. doi: https://doi.org/10.1101/2021.12.01.21267001. ↩
