conStruct

строить (непрерывную структуру) readme

Этот репо содержит код для конструкции метода - статистический инструмент для моделирования непрерывной и дискретной популяционной генетической структуры.

Рукопись, файлы данных и аналитические сценарии, связанные с публикацией, «выводя непрерывную и дискретную генетическую структуру популяции по всему космосу», были перемещены и могут быть доступны по приведенным ниже ссылкам:

• бумага
• Рукопись репо
• ДАННЫЕ ДИАДА

Установка

Последний релиз

Чтобы установить самый последний выпуск пакета Construct R:

install.packages( " conStruct " )

После установки будут скомпилированы модели конструкций , которые могут выплевывать много текста и, возможно, некоторых предупреждений на экран. Это абсолютно нормально, и вы должны быть обеспокоены, только если вы получите ошибки, а установка не удается.

Версия разработки

Чтобы установить версию разработки от GitHub:

	library( devtools )
	install_github( " gbradburd/conStruct " , build_vignettes = TRUE )

Обратите внимание, что пользователям Windows, возможно, придется загрузить RTools в качестве автономного исполняемого файла, прежде чем пытаться установить пакет Construct R.

Начиная

Полное руководство для всех документированных функций доступно здесь.

Кроме того, в упаковку включены четыре виньетки, которые подробно проходят различные шаги в конвейере анализа. Вы можете найти их, используя:

 # formatting data
	vignette( topic = " format-data " , package = " conStruct " )

# how to run a conStruct analysis
	vignette( topic = " run-conStruct " , package = " conStruct " )

# how to visualize the output of a conStruct model
	vignette( topic = " visualize-results " , package = " conStruct " )

# how to compare and select between different conStruct models
	vignette( topic = " model-comparison " , package = " conStruct " )

Существует также пример файла данных, включенный в пакет, который вы можете загрузить, используя команду:

	data( conStruct.data )

Контакт

Ссылаясь на руководство и виньетки, пожалуйста, направьте все вопросы Bradburd (at) umich.edu, или отправьте в качестве вопросов в репо.