ViMO

Вимо

Визуализатор для Meta-Omics (VIMO)-это интерактивное приложение на основе R, чтобы облегчить интеграцию данных между метагеномикой, Metatranscriptomics и MetaproteOmics. В то же время VIMO стремится предоставить пользователю интерактивные, готовые к публикации и соответствующие графические представления данных.

Vimo можно получить онлайн здесь:
https://magnusarntzen.shinyapps.io/visualizerformetaomics/

VIMO интегрирует данные из

• Метагеномика
• Metatranscriptomics
• Метапреромеома
• Таксономия
• Качественные меры
• Функции KEGG и завершение модуля
• Углеводы-активные ферменты (казимы)

Vimo делает участки:

• Маг -качество
• Вопрос в разных файлах
• Категории кацима в различных магах и их обидке на уровне транскрипта и белка
• Категории KEGG в различных журналах и их обидке на уровне транскрипта и белка
• Фракции завершения модуля KEGG, чтобы увидеть метаболический потенциал для каждого MAG

Некоторый пример вывода:

Отчеты об ошибках

Пожалуйста, сообщите об ошибках через систему проблем Github.

Copyright (C) 2023, Магнус Арнцен, Норвежский университет науки о жизни