บาง

SLiM เป็นเฟรมเวิร์กการจำลองเชิงวิวัฒนาการที่รวมกลไกอันทรงพลังสำหรับการจำลองทางพันธุกรรมของประชากรเข้ากับความสามารถในการสร้างแบบจำลองสถานการณ์วิวัฒนาการที่ซับซ้อนตามอำเภอใจ การจำลองได้รับการกำหนดค่าผ่านภาษาสคริปต์ Eidos ในตัว ซึ่งช่วยให้สามารถควบคุมสถานการณ์จำลองได้จริงในทุกแง่มุม กลไกการจำลองแบบอิงรายบุคคลนั้นได้รับการปรับให้เหมาะสมอย่างยิ่งเพื่อให้สามารถจำลองโครโมโซมทั้งหมดในประชากรจำนวนมากได้ นอกจากนี้เรายังมีอินเทอร์เฟซผู้ใช้แบบกราฟิกที่เรียกว่า SLiMgui บน macOS, Linux และ Windows เพื่อการตั้งค่าการจำลองที่ง่ายดาย การควบคุมรันไทม์แบบโต้ตอบ และการแสดงภาพเอาต์พุตการจำลองแบบไดนามิก

พื้นที่เก็บข้อมูล GitHub นี้โฮสต์ SLiM และ SLiMgui เวอร์ชันต้นน้ำสำหรับการพัฒนา

โดยทั่วไปผู้ใช้ปลายทางไม่ควรใช้แหล่งข้อมูลเหล่านี้ อาจมีข้อบกพร่องร้ายแรงหรืออาจไม่ได้คอมไพล์ด้วยซ้ำ

SLiM และ SLiMgui เวอร์ชัน วางจำหน่าย มีอยู่ที่ http://messerlab.org/slim/

ใบอนุญาต

ลิขสิทธิ์ (c) 2016-2024 ฟิลิปป์ เมสเซอร์ สงวนลิขสิทธิ์.

SLiM เป็นซอฟต์แวร์เสรี: คุณสามารถแจกจ่ายซ้ำและ/หรือแก้ไขได้ภายใต้เงื่อนไขของ GNU General Public License ตามที่เผยแพร่โดย Free Software Foundation ไม่ว่าจะเป็นเวอร์ชัน 3 ของใบอนุญาต หรือ (ตามตัวเลือกของคุณ) เวอร์ชันที่ใหม่กว่า

SLiM ได้รับการเผยแพร่ด้วยความหวังว่าจะมีประโยชน์ แต่ไม่มีการรับประกันใดๆ โดยไม่มีการรับประกันโดยนัยถึงความสามารถในการค้าขายหรือความเหมาะสมสำหรับวัตถุประสงค์เฉพาะ ดูใบอนุญาตสาธารณะทั่วไปของ GNU สำหรับรายละเอียดเพิ่มเติม

คุณควรได้รับสำเนาของ GNU General Public License พร้อมด้วย SLiM ถ้าไม่ โปรดดู http://www.gnu.org/licenses/

การพัฒนาและข้อเสนอแนะ

SLiM อยู่ระหว่างการพัฒนา และเป้าหมายของเราคือการทำให้มีประโยชน์ในวงกว้างมากที่สุดเท่าที่จะเป็นไปได้ หากคุณมีข้อเสนอแนะหรือคำขอคุณลักษณะ หรือหากคุณสนใจที่จะมีส่วนร่วมใน SLiM โปรดติดต่อ Philipp Messer ที่ [email protected] โปรดทราบว่า Philipp กำลังมองหานักศึกษาระดับบัณฑิตศึกษาและ postdocs ด้วย

การติดตั้ง

กำลังมองหาแพ็คเกจไบนารี / ตัวติดตั้งอยู่ใช่ไหม?

ส่วนย่อยต่อไปนี้จะสรุปวิธีการรับ SLiM (และ SLiMgui) ที่ใช้ได้ การสร้างจากแหล่งที่มาก็เป็นตัวเลือกในทุกแพลตฟอร์มเช่นกัน ดูหัวข้อถัดไป บทที่ 2 ของคู่มือ SLiM มีรายละเอียดมากขึ้นเกี่ยวกับการติดตั้งและการสร้าง SLiM คู่มือและแหล่งข้อมูล SLiM อื่นๆ สามารถพบได้ที่ http://messerlab.org/slim/

ระบบปฏิบัติการ macOS

ดาวน์โหลดและดับเบิลคลิกตัวติดตั้ง macOS จากหน้าแรกของ SLiM ที่ https://messerlab.org/slim/#Downloads มันจะติดตั้งเครื่องมือบรรทัดคำสั่ง slim และ eidos รวมถึง SLiMgui

ลินุกซ์

อาร์ช & มันจาโร

การแจกแจงแบบอิง Arch ใด ๆ ที่รองรับ AUR ควรเข้ากันได้

https://aur.archlinux.org/packages/slim-simulator/

Fedora, เรดแฮท, openSUSE

การแจกแจงแบบอนุพันธ์ไม่รับประกันความเข้ากันได้กับแพ็คเกจไบนารีเหล่านี้ เปิดใช้งานพื้นที่เก็บข้อมูลสำหรับระบบปฏิบัติการของคุณ คุณอาจลองใช้แพ็คเกจ RPM ต้นทางเพื่อสร้างแพ็คเกจใหม่สำหรับระบบของคุณ เพื่อให้คุณสามารถบูรณาการที่ยอดเยี่ยมสำหรับการแจกจ่ายตาม RPM

https://copr.fedorainfracloud.org/coprs/bacarson/SLiM-Selection_on_Linked_Mutations/

Debian & Ubuntu (และอนุพันธ์ใด ๆ ที่ใช้ dpkg)

เชลล์สคริปต์ที่ใช้สิ่งอำนวยความสะดวกของ dpkg พร้อมใช้งาน ใช้เป้าหมายการติดตั้ง CMake เพื่อรวม SLiMgui เข้ากับสภาพแวดล้อมเดสก์ท็อป มีข้อได้เปรียบเหนือการสร้างจากแหล่งที่มา โดยจะตรวจสอบการขึ้นต่อกันของบิวด์สำหรับคุณ และจะลบบิวด์อาร์ติแฟกต์ออกจาก /tmp โดยอัตโนมัติ จัดทำสคริปต์ด้วย curl ตามคำแนะนำในคู่มือ

https://raw.githubusercontent.com/MesserLab/SLiM-Extras/master/installation/DebianUbuntuInstall.sh

หน้าต่าง (10 และ 11)

แพ็คเกจดั้งเดิม (ใช้ MSYS2)

หากคุณติดตั้ง MSYS2 คุณสามารถทำ pacman -Syu เพื่ออัปเดตข้อมูลได้ (ดูคู่มือ SLiM สำหรับข้อมูลเพิ่มเติม) จากนั้นคุณสามารถติดตั้ง SLiM และ SLiMgui ด้วย:

pacman -S mingw-w64-x86_64-slim-simulator

คู่มือการติดตั้ง WSL2

คู่มือ SLiM ให้คำแนะนำโดยละเอียดเกี่ยวกับการสร้างและติดตั้ง SLiM และ SLiMgui ภายใต้ WSL2

การรวบรวม SLiM จากแหล่งที่มา

คุณสามารถสร้างทั้ง SLiM และ SLiMgui จากแหล่งที่มา สิ่งนี้มีประโยชน์ โดยเฉพาะอย่างยิ่ง หากคุณต้องการใช้งาน SLiM เวอร์ชันการพัฒนาล่าสุด แทนที่จะเป็นเวอร์ชันที่เผยแพร่ล่าสุด ดูบทที่ 2 ของคู่มือ SLiM สำหรับข้อมูลเพิ่มเติมเกี่ยวกับการสร้างจากแหล่งที่มาบนแพลตฟอร์มต่างๆ