忍者必须死3官服和渠道服互通，玩家在官服和渠道服的好友一起游戏，但是官服的账号不能在渠道服登录，而渠道服的账号也无法在官服登录，虽然玩法互通，但是数据还是相对独立的。
在忍者必须死3中，游戏中共有5名主角，其能力与属性也各不相同。忍者拥有两个不同的流派，不同的流派拥有独立的忍术及对应的天赋树；流派可以在战斗中切换。同一忍者的两个流派可以携带同一件宝物，但武器不可继承。
忍者必须死3玩家的注意事项。
玩家在玩忍者必须死3时要注意，该游戏武器通常是通过商城内的宝箱来获取，白银宝箱可以获取N~R阶的武器，黄金宝箱则可以获取R~SSR阶的武器。此外，玩家亦可以通过部分活动获取到武器。武器均可以被分解成为骨头，玩家可以在特定的商店内用骨头换取扳手、SR/SSR级武器、强化锤等道具。