过多地使用Flash和AJAX技术会给搜索引擎带来很多问题。因为搜索引擎不能很好地索引完全由Flash或AJAX表现的网页。原因很简单，搜索引擎只索引页面，而不会索引应用程序。
此外，即使搜索引擎做到了能完全解释Flash文件或者AJAX应用程序，并能分析和索引它们的相关内容，也还是没有任何办法使用URL来导航应用程序。搜索引擎的主要目的是将搜索结果提交给用户，但当处理这些媒体信息时，搜索引擎将无法排列这些信息的顺序。总之，Flash和AJAX带来更多创意的同时，也导致更多难侦测的垃圾网站的产生。
我们并不完全排斥使用Flash和AJAX，有一种方法可以克服上述问题。网站设计者应该仅在需要使用Flash和AJAX的地方使用它，这就是所谓的调和方法(blended approach)。设计人员应该主要使用HTML语言设计网站，而将Flash和AJAX作为辅助技术，为用户提供切实的好处。在设计时，要尽可能多的基于HTML的文本内容。
通常，HTML和JavaScript的混合(DHTML)也基本上可以达到使用这些技术的效果。例如，单击一个按钮可以显示或隐藏一个HTML的div单元。这样就可以将很小的Flash或AJAX单元设置在传统的HTML版面中。也就是说，在使用Flash和AJAX时应该把它们当成页面上的单元，而不是页面本身。