在怪獸彈珠的遊戲介面中，點選「強化合成」按鈕，選擇合成主體怪物，之後再選擇合成的材料怪物即可進行強化合成。合成之後，可以增加主體怪物的經驗，進行升級。
使用相同的怪物進行合成可以提高幸運值，幸運值越高，過關獎勵也會越好。雖然普通的怪物也可以獲得經驗，但相比經驗龜來說，就少的多了，所以通常還是使用經驗龜進行強化合成的。
1.強化需要消耗大量的金錢：強化合成需要消耗大量的金錢，所以請確保你的遊戲內金錢充足。
2.注意保護特別重要的怪物：強化合成時，要特別注意保護你特別重要的怪物，以免操作失誤導致重要的彈珠被當素材合成掉，從而無法撤銷。
3.同屬性經驗龜的強化效果較佳：建議使用同屬性的經驗龜進行彈珠強化升級，因為經驗是其它屬性的1.5倍，這樣可以節省大量的經驗，同時也可以讓經驗龜的效果最大化。
4.疊蛋效果不適用於烏龜：疊蛋效果指的是彈珠強化時，烏龜的疊加效果不適用。要先讓烏龜吃滿三圍再給彈珠吃，才能達到更好的效果。同時，烏龜的疊加效果不會因為其他彈珠的疊加而增加，所以要確保烏龜先疊在一起。
5.億經龜需要活動開放或超絕降臨才能獲得：億經龜只有在活動開放或超絕降臨時才能獲得，日常龜關卡無法獲得。
6.強化可以用來自提升等級，也可以用來提升彈珠的額外三圍：強化不僅可以幫助你提升等級，還可以提升彈珠的額外三圍，讓你的彈珠更具威力。