這兩個遊戲的發行商是同一個。碧藍航線大獲成功後，發行商推出了碧藍檔案。雖然兩個遊戲的名字相似，但是差別還是很多的。碧藍航線是軍武類遊戲。遊戲中設置了多種船艦、裝備。玩家在遊戲中不僅可以打撈、強化艦船，還可以搭配陣容對抗敵方艦隊。雖然碧藍檔案一樣和軍武相關，但是劇情、內容上卻大大不同。玩家在遊戲的角色是學院老師。在遊戲的世界裡，使用槍械作戰是合法的。玩家需要帶領學生解決遊戲中出現的一個又一個問題。
