以最終客戶的角度來看，JAR文件就是一種封裝，他們不需要知道jar檔中有多少個.class文件，每個文件中的功能與作用，同樣可以得到他們希望的結果。除jar以外對於J2EE還有war和ear。差異見下表：
| JAR | WAR | EAR | |
| 英文 | Java Archive file | Web Archive file | Enterprise Archive file |
| 包含內容 | class、properties文件，是文件封裝的最小單元；包含Java類別的普通庫、資源（resources）、輔助文件（auxiliary files）等 | Servlet、JSP頁面、JSP標記庫、JAR庫文件、HTML/XML文件和其他公用資源文件，如圖片、音訊檔案等 | 除了包含JAR、WAR以外，還包含EJB組件 |
| 部署文件 | application-client.xml | web.xml | application.xml |
| 容器 | 應用程式伺服器（application servers） | 小型服務程序容器（servlet containers） | EJB容器（EJB containers） |
| 等級 | 小 | 中 | 大 |
(1)EAR文件的打包
EAR檔案包含整個項目，包含多個EJB Module（JAR檔案）和Web Module（WAR檔案）。
EAR檔案的產生可以使用winrar以zip壓縮方式或從命令列以jar指令來產生。
步驟：
1>、先打包成war和jar，並寫好application.xml，放到META-INF目錄下。
2>、執行jar cf your_application.ear your_war.war your_jar.jar META-INF/application.xml （假設都在目前目錄下）。
當然也可以用jar xf your_application.ear來解壓縮。
application.xml是用來描述你的ear中包含的war和jar
weblogic自帶的petstore的application.xml範例：
1>、產生war檔使用以下指令：jar -cvf web1.war *
2>、查看web1.war中都有哪些文件，可以使用指令：jar -tf web1.war
3>、解壓縮web1.war文件，可以使用指令：jar -xvf web1.war
另外，也可使用winrar軟體選擇zip壓縮方式，並將壓縮檔案後綴名改為war即可壓縮產生war檔；同樣使用winrar軟體可以強行開啟war 文件，或是強行解壓縮war文件
使用jar指令與winrar軟體的差別在於前者在壓縮檔案的同時會產生META-INF資料夾，內包含MANIFEST.MF檔。
(3)何時使用war或jar文件
當你的專案在沒有完全竣工的時候，不適合使用war文件，因為你的類會由於調試之類的經常改，這樣來回刪除、創建war文件很不爽，最好是你的項目已經完成了，不改了，那麼就打個war包吧，這時候一個war檔就相當於一個web應用程式；而jar檔就是把類別和一些相關的資源封裝到一個包中，以便於程式中引用。
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Java的打包jar、war、ear包的作用、區別、打包方式：
1、 作用與區別
i. jar：通常是開發時要引用通用(JAVA)類，打成包便於存放管理；
ii. war：是做好一個(web)應用程式後，通常是網站，打成包部署到容器中；
iii. ear： 企業級應用，實際上EAR包中包含WAR包和幾個企業級項目的設定檔而已，一般伺服器選擇WebSphere等，都會使用EAR包。通常是EJB打成ear包。
2、打包方式
i. 所有的包都是用jar打的，只不過目標檔的副檔名不一樣；
ii. 也可以用Ant來安成建構。
3.JET編譯成EXE
i. JET 是要用錢買的，而且據說JET 也不是能把所有的Java 程式都編譯成執行文件，性能也要打些折扣。所以，使用製作可執行JAR 檔案包的方法就是最佳選擇了，何況它還能保持Java 的跨平台特性。
注意：
將web專案以war的方式匯出後，直接放在tomcat容器的webapps下，啟動服務，即可運行該項目，該war包會自動解壓縮出同名的資料夾。