رابد
ملحوظة: هذا المشروع قيد التطوير وهو قيد التطوير. من المفترض أن يستقر الكود بشكل ملحوظ في يونيو 2021.
حزمة للفهرسة الآلية والاستراتيجية والتكامل والتحليل والحلول الهيكلية للبيانات البلورية الجزيئية.
نقوم حاليًا ببناء قدرات سطر الأوامر وإضافة أدوات الكشف إلى البرنامج.
الأوامر الحالية:
- تحليل - تحليل مجموعة بيانات MX وتنفيذ pdbquery
- get_cif - احصل على ملف CIF من PDB برمز مكون من 4 أحرف
- get_pdb - احصل على ملف PDB من PDB برمز مكون من 4 أحرف
- hdf5_to_cbf - تحويل ملفات hdf5 إلى CBF
- الفهرس - فهرسة بيانات MX وحساب استراتيجيات جمع البيانات
- دمج - دمج بيانات MX
- pdbquery - مقارنة البيانات بهياكل الإدخال أو الملوثات الشائعة أو الهياكل الموجودة في PDB مع معلمات خلية الوحدة المماثلة
أوامر المطور:
- إنشاء - إنشاء ملفات قالبة RAPD جديدة
- print_detector - طباعة معلومات ملف الصورة
- python - python CLI مع واردات RAPD الكاملة المتاحة
- اختبار - اختبار runner لمشروع RAPD
- الإصدار - يطبع إصدار RAPD الحالي المثبت
- xds_to_dict - يحول XDS.INP إلى إملاء بيثون لتضمينه في ملف كاشف RAPD
أجهزة الكشف عن الموقع الحالية مدعومة (المزيد قادم):
وكالة الأنباء الجزائرية
- aps_gmca_dectris_eiger16m
- lscat_dectris_eiger9m
- lscat_rayonix_mx300
- necat_dectris_eiger16m
- necat_dectris_pilatus6mf
- sercat_rayonix_mx300hs
جامعة كاليفورنيا
للحصول على إرشادات حول التثبيت والإعداد، راجع install/README.md