lyprox

ما هو lyprox ؟

إنه تطبيق ويب Django يعرض الأنماط التفصيلية للانتشارات اللمفاوية في سرطان الرأس والرقبة ويسمح للمرء باستكشاف مجموعة (مجموعات) البيانات الأساسية بمزيد من التفصيل. يتم استضافته تحت عنوان URL https://lyprox.org.

تحفيز

ينتشر HNSCC عبر الجهاز اللمفاوي للرقبة ويشكل نقائل في العقد الليمفاوية الإقليمية. يمكن اكتشاف النقائل المجهرية باستخدام طرق التصوير مثل التصوير بالرنين المغناطيسي، والتصوير المقطعي بالإصدار البوزيتروني، والتصوير المقطعي المحوسب. ومن ثم يتم تضمينها في الحجم المستهدف، عند اختيار العلاج الإشعاعي كجزء من العلاج. ومع ذلك، فإن النقائل المجهرية صغيرة جدًا بحيث لا يمكن تشخيصها باستخدام تقنيات التصوير الحالية.

ولمراعاة هذه المشاركة المجهرية، غالبًا ما يتم تشعيع أجزاء من الجهاز اللمفاوي بشكل اختياري لزيادة السيطرة على الورم. يتم حاليًا تحديد الأجزاء المضمنة في هذا المجلد المستهدف السريري الاختياري بناءً على الإرشادات ^{1 2 3 4} . وهذه بدورها مستمدة من تقارير عن مدى انتشار الإصابة لكل مستوى العقدة الليمفاوية (LNL)، أي جزء من المرضى الذين تم تشخيص إصابتهم بالانبثاث في أي مستوى عقدة ليمفاوية معين، مقسمة حسب موقع الورم الرئيسي. من المستحسن تضمين LNL في الحجم المستهدف الاختياري إذا أظهر 10-15% من المرضى تورطًا في هذا المستوى المعين.

ومع ذلك، في حين تم الإبلاغ عن انتشار المشاركة في الأدبيات ^{5 6} ، وأن مسارات التصريف اللمفاوي العامة مفهومة جيدًا، إلا أن أنماط التقدم التفصيلية لـ HNSCC لا تزال ضعيفة التحديد كميًا. نحن نعتقد أن خطر المشاركة المجهرية في LNL يعتمد بشكل كبير على التشخيص المحدد لمريض معين وبالتالي يمكن تخصيص علاجه إذا تم تحديد أنماط التقدم بشكل أفضل.

هدفنا

من خلال الواجهة، نهدف في المقام الأول إلى تسهيل الوصول إلى مجموعة البيانات المستخرجة. من خلال تصوره بشكل تفاعلي، يمكن للمرء بسرعة كبيرة اختبار أو التوصل إلى فرضية فيما يتعلق بالانتشار اللمفاوي لـ HNSCC. ونأمل أن يحفز هذا بدوره الباحثين الآخرين على التحقيق في هذه الفرضيات واستخراج ومشاركة المزيد من البيانات بتفاصيل مماثلة.

وهذا بدوره سيمكننا (أو أي شخص آخر) من بناء نماذج أكثر دقة ودقة لتطور الورم. على سبيل المثال، مثل العمل السابق حول استخدام الشبكات الافتراضية للتنبؤ بالاحتمالية الشخصية للمشاركة ⁷ أو منشورنا الأخير حول هذه المشكلة باستخدام نماذج ماركوف المخفية وبالتالي تقديم طريقة واضحة لنمذجة الوقت ⁸ .

مجموعات بيانات أنماط التقدم اللمفاوي

البيانات التي يتم تصورها في هذه الواجهة موجودة في مستودع مفتوح المصدر بمفرده: lyDATA.

لقد قمنا أيضًا بنشر ورقة بحثية حول مجموعة البيانات والواجهة في العلاج الإشعاعي وعلم الأورام ⁹ ، مع توفر نسخة أولية على medRxiv ¹⁰ .

النماذج الاحتمالية لتعريف CTV الشخصي

نحن نعمل أيضًا على النماذج الاحتمالية ^{7 8} التي قد تتنبأ بالانتشار اللمفاوي لسرطان الرأس والرقبة. تتم استضافة الكود الأساسي في مستودع آخر: Lymph.

كيفية المساهمة

هناك طريقتان يمكنك من خلالهما المساهمة في هذا المشروع:

1. إذا كنت باحثًا سريريًا في هذا المجال وترغب في مشاركة بياناتك معنا، فيرجى التواصل معنا عبر البريد الإلكتروني: [email protected].
2. والطريقة الأخرى هي من خلال المساهمة في هذا المستودع، على سبيل المثال، إذا كنت مطور برامج. أعتقد أن هذا غير مرجح إلى حد ما، نظرًا للنطاق المحدد جدًا لتطبيق Django هذا، لكننا ما زلنا نرحب بأي مساهمة. في هذه الحالة، يمكن العثور على وثائق مفصلة للكود المصدري على صفحات GitHub.

قم بتشغيل هذه الواجهة محليًا

إذا كنت تريد استضافة بياناتك بنفسك أو تجربة الشكل الذي تظهر به بياناتك في تطبيق الويب دون الالتزام بالتحميل، فلا تتردد في اتباع هذه الإرشادات لإعدادها وتشغيلها على جهازك المحلي.

الحواشي

1. فنسنت غريغوار وآخرون، اختيار وتحديد الأحجام المستهدفة للعقدة الليمفاوية في العلاج الإشعاعي المطابق للرأس والرقبة. اقتراح لتوحيد المصطلحات والإجراءات على أساس الخبرة الجراحية ، العلاج الإشعاعي وعلم الأورام ، المجلد. 56، الصفحات 135-150، 2000، دوى: https://doi.org/10.1016/S0167-8140(00)00202-4. ↩

2. Vincent Grégoire، A. Eisbruch، M. Hamoir، and P. Levendag، اقتراح لترسيم CTV العقدي في العقدة الإيجابية والرقبة بعد العملية الجراحية ، العلاج الإشعاعي وعلم الأورام ، المجلد. 79، لا. 1، الصفحات 15-20، أبريل 2006، دوى: https://doi.org/10.1016/j.radonc.2006.03.009. ↩

3. فنسنت غريغوار وآخرون، تحديد مستويات عقدة الرقبة لأورام الرأس والرقبة: تحديث عام 2013. DAHANCA، EORTC، HKNPCSG، NCIC CTG، NCRI، RTOG، TROG إرشادات الإجماع ، العلاج الإشعاعي وعلم الأورام ، المجلد. 110، لا. 1، الصفحات 172-181، يناير 2014، دوى: https://doi.org/10.1016/j.radonc.2013.10.010. ↩

4. جوليان بياو وآخرون، اختيار الأحجام المستهدفة للعقدة الليمفاوية للعلاج الإشعاعي النهائي للرأس والرقبة: تحديث عام 2019 ، العلاج الإشعاعي وعلم الأورام ، المجلد. 134، الصفحات من 1 إلى 9، مايو 2019، دوى: https://doi.org/10.1016/j.radonc.2019.01.018. ↩

5. جاتين. P. Shah، FC Candela، وAK Poddar، أنماط نقائل العقدة الليمفاوية العنقية من السرطان الحرشفي في تجويف الفم ، السرطان ، المجلد. 66، لا. 1، الصفحات من 109 إلى 113، 1990، دوى: https://doi.org/10.1002/1097-0142(19900701)66:1%3C109::AID-CNCR2820660120%3E3.0.CO;2-A. ↩

6. Laurence Bauwens et al.، انتشار وتوزيع نقائل العقدة الليمفاوية العنقية في سرطان الخلايا الحرشفية الفموية البلعومية الإيجابية والسلبية لفيروس الورم الحليمي البشري ، العلاج الإشعاعي وعلم الأورام ، المجلد. 157، الصفحات 122-129، أبريل 2021، دوى: https://doi.org/10.1016/j.radonc.2021.01.028. ↩

7. Bertrand Pouymayou، P. Balermpas، O. Riesterer، M. Guckenberger، and J. Unkelbach، نموذج شبكة بايزي لتطور الورم اللمفاوي لتعريف CTV اختياري شخصي في سرطانات الرأس والرقبة ، الفيزياء في الطب والبيولوجيا ، المجلد. 64، لا. 16، ص. 165003، أغسطس 2019، دوي: https://doi.org/10.1088/1361-6560/ab2a18. ↩ ↩ ²

8. Roman Ludwig، B. Pouymayou، P. Balermpas، and J. Unkelbach، نموذج ماركوف مخفي لتطور الورم اللمفاوي في الرأس والرقبة ، Sci Rep ، المجلد. 11، لا. 1، ص. 12261، ديسمبر 2021، دوي: https://doi.org/10.1038/s41598-021-91544-1. ↩ ↩ ²

9. رومان لودفيغ وآخرون، تقارير مفصلة للمريض والفرد عن تورط العقدة الليمفاوية في سرطان الخلايا الحرشفية الفموية البلعومية مع واجهة عبر الإنترنت ، العلاج الإشعاعي وعلم الأورام ، فبراير 2022، دوي: https://doi.org/10.1016/j.radonc.2022.01 .035. ↩

10. رومان لودفيج، ج.-م. هوفمان، بي بويمايو وآخرون، تقارير مفصلة للمريض والفرد عن تورط العقدة الليمفاوية في سرطان الخلايا الحرشفية الفموية البلعومية من خلال واجهة عبر الإنترنت ، medRxiv ، ديسمبر 2021. doi: https://doi.org/10.1101/2021.12.01.21267001. ↩