dimple
1.0.0
خط أنابيب تصوير البلورات الجزيئي للجدل للصقل وفحص يجند.
Dimple جزء من جناح CCP4. يتم كل العمل من قبل برامج أخرى من الجناح ، والتي يتم تشغيلها تحتها. الأهم من ذلك refmac و phaser . لذلك تحتاج إلى تثبيت CCP4.
لاختبار أحدث إصدار للتطوير ، استنساخ هذا المستودع وتشغيل ./dimple/dimple .
يأتي Dimple مع أداة find-blobs الصغيرة. إذا لم تقم بتجميعه ، فسيتم استخدام الإصدار من مجموعة CCP4. يتطلب التجميع مكتبة Clipper والتي بدورها تتطلب MMDB2 و LIBCCP4. يمكنك إما بناء كل شيء من المصدر أو استخدام Conda لتنزيل الثنائيات التي تم تجميعها باستخدام GCC 4.8. يمكن أن يتم هذا الأخير عن طريق تثبيت Miniconda والقيام:
conda install -c mw clipper
من إنشاء bind-blobs يشير إلى مكان المكتبات المطلوبة:
export CXXFLAGS="-D_GLIBCXX_USE_CXX11_ABI=0 -std=c++98" # for GCC 5
cmake -D CMAKE_PREFIX_PATH=$HOME/miniconda2 .
make
لا حاجة إلى التثبيت - هبط الثنائي في نفس الدليل الذي ستستخدمه البرامج النصية Python و Dimple برامج من هنا لتفضيل إلى تلك من $CCP4/bin .
إذا لم ينجح - راجع طرق الاتصال أدناه.
أي أفكار أو تعليقات أو ملاحظات مرحب بها. إذا لم ينجح الأمر كما هو متوقع أو لا يعمل على الإطلاق - فأخبرنا في أسرع وقت ممكن. استخدم تعقب المشكلات أو البريد الإلكتروني CCP4 Helpdesk أو أرسل بريدًا إلكترونيًا إلى [email protected] أو.
صنع في مصدر ضوء الماس وفي CCP4-Harwell.
