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Medicat

Medicat ist ein Datensatz mit medizinischen Bildern, Bildunterschriften, Annotationen für Unterstellungsunterkapitionen und Inline-Textreferenzen. Anweisungen für den Zugang werden hier gegeben.

Figuren und Bildunterschriften werden aus Open -Access -Artikeln in PubMed Central extrahiert und entsprechender Referenztext wird von S2ORC abgeleitet.

Der Datensatz besteht aus:

217.060 Zahlen aus 131.410 Open Access Papers
7507 Subkaption- und Subform -Annotationen für 2069 Verbindungsfiguren
Inline -Referenzen für ~ 25K -Zahlen im ROCO -Datensatz

Eine Stichprobe der Daten ist in sample/ verfügbar.

Eine Beispieldateneingabe:

 {
  "pdf_hash": "57c9ad0f4aab133f96d40992c46926fabc901ffa",
  "fig_key": "Figure1",
  "fig_uri": "2-Figure1-1.png",
  "s2_caption": "Figure 1. (A) Barium enema and (B) endoscopic image of the high-grade distal colonic obstruction caused by a 5-cm anastomotic stricture.",
  "s2orc_caption": "Figure 1. (A) Barium enema and (B) endoscopic image of the high-grade distal colonic obstruction caused by a 5-cm anastomotic stricture.",
  "s2orc_references": [
    "Computed tomography (CT) showed a distal large bowel obstruction, and a barium enema revealed a high-grade stenosis proximal to the anastomotic site in the recto-sigmoid region (Figure 1 ).",
    "Flexible sigmoidoscopy revealed a tight, fibrotic, benign-appearing anastomotic stricture 15 cm from the anal verge ( Figure 1) ."
  ],
  "radiology": false,
  "scope": true,
  "predicted_type": "Medical images",
  "oa_info": {
    "doi": "10.14309/crj.2014.54",
    "doi_url": "https://doi.org/10.14309/crj.2014.54",
    "oa": {
      "is_oa": true,
      "oa_status": "gold",
      "journal_is_oa": true,
      "journal_is_in_doaj": true,
      "license": "cc-by-nc-nd",
      "provenance": "unpaywall"
    }
  }
}

Die entsprechende Abbildung befindet sich in figures/57c9ad0f4aab133f96d40992c46926fabc901ffa_2-Figure1-1.png ( {pdf_hash}_{fig_uri} ).

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Code

Bitte beachten Sie das code -Verzeichnis für den Code, der mit unserem Artikel verknüpft ist. Der code/README.md enthält zusätzliche Informationen darüber, wie Sie diesen Code verwenden können.

Zitieren:

Wenn Sie diesen Datensatz verwenden, zitieren Sie bitte:

 @inproceedings{subramanian-2020-medicat,
    title={{MedICaT: A Dataset of Medical Images, Captions, and Textual References}},
    author={Sanjay Subramanian, Lucy Lu Wang, Sachin Mehta, Ben Bogin, Madeleine van Zuylen, Sravanthi Parasa, Sameer Singh, Matt Gardner, and Hannaneh Hajishirzi},
    year={2020},
    booktitle={Findings of EMNLP},
}

Lizenz

Jedes Quelldokument in Medicat ist unterschiedlich lizenziert. In Medicat enthaltene Artikel verfügen über Open -Access -Lizenzen (siehe CC und UPW) oder sind öffentlich zugänglich. Die Lizenz für jeden Artikel ist im zugehörigen Eintrag im Datensatz bereitgestellt. Bitte halten Sie diese Lizenzen bei Verwendung. Der Medicat-Datensatz ist nur für den nicht kommerziellen Gebrauch verfügbar.