RAPD
NB – Ce projet est en cours de développement et est à la pointe de la technologie. Le code devrait se stabiliser significativement en juin 2021.
Un package pour une solution automatisée d'indexation, de stratégie, d'intégration, d'analyse et de structure des données cristallographiques macromoléculaires.
Actuellement, nous développons les capacités de la ligne de commande et ajoutons des détecteurs au logiciel.
Commandes actuelles :
- analyser - analyser un ensemble de données MX et exécuter pdbquery
- get_cif - récupère un fichier CIF du PDB par un code à 4 caractères
- get_pdb - récupère un fichier PDB à partir du PDB par un code à 4 caractères
- hdf5_to_cbf - convertit les fichiers hdf5 en CBF
- index - indexer les données MX et calculer les stratégies de collecte de données
- intégrer - intégrer les données MX
- pdbquery - compare les données aux structures d'entrée, aux contaminants courants ou aux structures de la PDB avec des paramètres de cellule unitaire similaires
Commandes du développeur :
- générer - créer de nouveaux fichiers modèles RAPD
- print_detector - imprimer les informations du fichier image
- python - Python CLI avec importations RAPD complètes disponibles
- test - lanceur de tests pour le projet RAPD
- version - imprime la version RAPD actuellement installée
- xds_to_dict - transforme un XDS.INP en un dict python pour l'inclure dans le fichier du détecteur RAPD
Détecteurs de site actuels pris en charge (d'autres sont à venir) :
APS
- aps_gmca_dectris_eiger16m
- lscat_dectris_eiger9m
- lscat_rayonix_mx300
- necat_dectris_eiger16m
- necat_dectris_pilatus6mf
- sercat_rayonix_mx300hs
UCLA
Pour obtenir des instructions sur l'installation et la configuration, voir install/README.md
