Il s'agit d'une bibliothèque permettant de calculer rapidement les courbes de puissance pour l'effet détecté attendu dans les études d'association à l'échelle du génome.
Si vous souhaitez installer ce package pour une utilisation directe dans des scripts ou des notebooks, veuillez exécuter :
git clone https://gitlab.com/data-analysis5/qtl-power.git
cd qtl-power
pip install .
à installer directement à partir des sources.
Si vous êtes principalement intéressé par une expérience plus interactive, vous pouvez immédiatement utiliser plusieurs de nos cahiers prédéfinis via le lien mybinder
ci-dessus. Cela vous permettra d'utiliser la bibliothèque pour générer des tracés couramment utilisés pour comparer la puissance d'association génétique basée sur plusieurs paramètres d'entrée.
Actuellement, la documentation est conservée dans le répertoire /docs
et est construite à l'aide Sphinx
. Pour reconstruire la documentation :
cd docsrc
make clean html copy
cd ..
git add docs/
puis créez un commit qui créera un ensemble de documentation mis à jour.