Pekerjaan ini sedang berjalan di webrun dengan penerapan di (https://litgene.tumorai.org/).
Penerapan github (https://github.com/vinash85/GENELLM_WEBAPP) dapat digunakan untuk penerapan mandiri halaman web.
Gunakan halaman umpan balik di halaman alat LitGene atau hubungi penulis untuk memberikan umpan balik.
Tautan BioArxiv: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.08.07.606674v1
Berikut cara menjalankan kode contoh menggunakan Docker.
Bangun buruh pelabuhan:
A. Pergi ke lokasi file buruh pelabuhan setelah git clone "cd LitGene/dependencies/docker/"
B. Bangun buruh pelabuhan "buruh pelabuhan membangun .-t litgene"
Jalankan gambar buruh pelabuhan/buat wadah:
C. "buruh pelabuhan menjalankan --name Litgene --gpus=all --previleged --ports 8888:8888 -v litgene_location:/home/tailab/LitGene -dit litgene /bin/bash"
Masukkan buruh pelabuhan:
D. "buruh pelabuhan exec -it Litgene /bin/bash"
Di dalam buruh pelabuhan, buka kelarutan kode sampel:
e. "cd /home/tailab/LitGene/"
F. buka jupyter "jupyter notebook --ports 8888 --ip 0.0.0.0 --allow-root --no-browser"
Di sistem tempat buruh pelabuhan dikerahkan:
G. buka browser "https://localhost:8888"
H. masukkan tokennya
Saya. jalankan kode contoh "solubilityEval.ipynb"
atau buruh pelabuhan di sistem jarak jauh (opsional):
G. perintah terbuka pada sistem lokal
H. ketik "ssh -NL localhost:8888:localhost:8888 penggunanme@server"
Saya. ulangi langkah 5
(Jika tertarik dengan persyaratan Conda yang disediakan di LitGene/dependensi diuji pada Ubuntu 22 dengan python 3.12 dan driver nvidia 535.183.01 dan runtime cuda 12.2 pada GPU A100)
Pemfaktoran Ulang Kode sedang berlangsung di bawah code/refactored_code Untuk file data, model, dan file keluaran lainnya. Silakan menghubungi [[email protected]]
