Pembaruan Baru

08/03/24 : Abstrak baru tersedia untuk umum, memperkenalkan pendekatan baru untuk deteksi glaukoma: Penilaian Pembuluh Darah Retina untuk Deteksi Glaukoma: Analisis Komparatif Keahlian Manusia dan Algoritma Pembelajaran Mendalam.
15/05/24 : Folder kode EyePACS-light-V2 di Kaggle memiliki template PyTorch baru untuk pengaturan deteksi glaukoma yang cepat dan mudah. Model ini menggunakan MobileNetV3 yang ringan dan mencapai akurasi pengujian 92,6%: https://www.kaggle.com/code/deathtrooper/pytorch-easy-setup-for-glaucoma-detection-92-6
03/09/24 : EyePACS-light-V2 sekarang memiliki skor kegunaan Kaggle 10,0: file metadata.csv tambahan ditambahkan ke kumpulan data.
20/01/24 : Ikhtisar tingkat tinggi praproses EyePACS-light-V2 sekarang tersedia di tautan kumpulan data Kaggle di bagian tentang (gulir ke bawah) jika Anda penasaran bagaimana kumpulan data tersebut diperoleh
28/12/23 : Tolok ukur akurasi pengujian EyePACS-light-V2 94,94% menggunakan ConvNeXtTiny: https://www.kaggle.com/code/deathtrooper/benchmark-94-94-convnexttiny
12/12/23 : EyePACS-light-V2 DI SINI!!! Jadilah orang pertama yang melakukan tolok ukur model Anda dengan kumpulan data yang ditingkatkan ini! Unduh dari kaggle: https://www.kaggle.com/datasets/deathtrooper/glaucoma-dataset-eyepacs-airogs-light-v2/data

Catatan Kutipan

Jika Anda merasa katalog ini bermanfaat, mohon pertimbangkan untuk mengutip yang berikut ini:

Riley Kiefer, Muhammad Abid, Jessica Steen, Mahsa Raeisi Ardali, dan Ehsan Amjadian. 2023. Katalog Kumpulan Data Glaukoma Publik untuk Aplikasi Pembelajaran Mesin: Penjelasan mendetail dan analisis kumpulan data glaukoma publik yang tersedia bagi teknisi pembelajaran mesin yang menangani masalah terkait glaukoma menggunakan gambar fundus retina dan gambar OCT. Dalam Prosiding Konferensi Internasional ke-7 tentang Sistem Informasi dan Penambangan Data (ICISDM '23) tahun 2023. Asosiasi Mesin Komputasi, New York, NY, AS, 24–31. https://doi.org/10.1145/3603765.3603779

Katalog Kumpulan Data Glaukoma Publik

[Bantu perluas repositori ini dengan menyediakan tautan/publikasi ke kumpulan data glaukoma baru!]

Daftar Isi Repositori

README.md : Ikhtisar DrDeramus, penelitian yang relevan, dan tautan akses kumpulan data
benchmark-eyepacs-airogs-light.md : Papan peringkat untuk evaluasi set pengujian menggunakan set train/val dari set data EyePACS-AIROGS-light
ringkasan.md : Perincian kelas kumpulan data, jenis gambar, dan jenis glaukoma
data-availability.md : Gambar kumpulan data dan ketersediaan segmentasi.
origin.md : Asal pengumpulan kumpulan data dan tahun pengumpulan.

Sekilas tentang Glaukoma

Menurut AAO, "Glaukoma adalah penyakit yang merusak saraf optik mata Anda. Biasanya terjadi ketika cairan menumpuk di bagian depan mata Anda. Cairan berlebih tersebut meningkatkan tekanan di mata Anda, sehingga merusak saraf optik". Penyakit ini merupakan penyebab utama kebutaan dan akan memburuk seiring berjalannya waktu jika tidak ditangani. Dokter mata mendiagnosis glaukoma melalui gambar fundus (gambar 2D mata) atau gambar tomografi koherensi okular (OCT) (gambar 3D mata). Pada gambar fundus, dokter mata biasanya mencari kerusakan pada mangkuk optik atau cakram optik. Dalam gambar OCT, dokter mata biasanya mencari atrofi lapisan. Untuk mengotomatiskan deteksi glaukoma, kumpulan data dikurasi untuk pembelajaran mesin. Kumpulan data gambar fundus biasanya dirancang untuk klasifikasi glaukoma untuk membedakan sehat untuk glaukoma atau segmentasi kepala saraf optik untuk mengekstrak dan menganalisis kerusakan cangkir atau cakram. Kumpulan data benchmark berkualitas tinggi seperti EyePACS-AIROGS-light memiliki rangkaian pelatihan, validasi, dan pengujian yang telah ditentukan sebelumnya untuk reproduktifitas.

Kumpulan Data Glaukoma yang Relevan (oleh saya)

SMDG-19 [Kumpulan Data], "Kumpulan Data Multi-Saluran Standar untuk Glaukoma, Versi 19", https://www.kaggle.com/datasets/deathtrooper/multichannel-glaucoma-benchmark-dataset
EyePACS-AIROGS-light-v1 [Kumpulan Data], "Kecerdasan Buatan EyePACS untuk Tantangan Pemeriksaan Glaukoma yang Kuat, Versi Ringan 1", https://www.kaggle.com/datasets/deathtrooper/eyepacs-airogs-light
EyePACS-AIROGS-light-v2 [Kumpulan Data], "Kecerdasan Buatan EyePACS untuk Tantangan Pemeriksaan Glaukoma yang Kuat, Versi Ringan 2", https://www.kaggle.com/datasets/deathtrooper/glaucoma-dataset-eyepacs-airogs-light- v2

Penelitian Glaukoma yang Relevan (oleh saya)

ARVO 2024 [Abstrak], "Penilaian Pembuluh Darah Retina untuk Deteksi Glaukoma: Analisis Perbandingan Keahlian Manusia dan Algoritma Pembelajaran Mendalam", https://iovs.arvojournals.org/article.aspx?articleid=2794846
AAO 2022 [Abstrak], "Survei Komprehensif Kumpulan Data Glaukoma yang Tersedia untuk Publik untuk Deteksi Glaukoma Otomatis", https://aaopt.org/past-meeting-abstract-archives/?SortBy=ArticleYear&ArticleType=&ArticleYear=2022&Title=&Abstract=&Authors=&Affiliation=&PROGRAMNUMBER=225129
AAO 2023 [Abstrak], "Kekuatan Prediktif Pembuluh Darah Fundus dalam Deteksi Glaukoma", diterima sebagai presentasi AAO 2023
AAO 2023 [Abstrak], "EyePACS-light: A Lightweight Balanced Dataset for Automated Glaucoma Classification Modeling", diterima sebagai poster untuk AAO 2023
ARVO 2023 [Abstrak], "Validasi kebenaran dasar dari kumpulan data yang tersedia untuk umum yang digunakan dalam model kecerdasan buatan untuk deteksi glaukoma", https://iovs.arvojournals.org/article.aspx?articleid=2791017
ARVO 2023 [Abstrak], "Kumpulan Data Glaukoma Standar dan Akses Terbuka untuk Aplikasi Kecerdasan Buatan", https://iovs.arvojournals.org/article.aspx?articleid=2790420
IEEE-IEMCOM 2022 [Makalah Lengkap], "Survei Algoritma Deteksi Glaukoma menggunakan Gambar Fundus dan OCT", https://ieeexplore.ieee.org/abstract/document/9946629
IEEE-ICIVC 2023 [Makalah Lengkap], "Standarisasi Gambar Fundus Otomatis Menggunakan Algoritma Ambang Batas Depan Global Dinamis", https://ieeexplore.ieee.org/abstract/document/10270429
ICISDM 2023 [Makalah Lengkap], "Katalog Kumpulan Data Glaukoma Publik untuk Aplikasi Pembelajaran Mesin", https://dl.acm.org/doi/abs/10.1145/3603765.3603779

Contoh datanya

Drishti-GS	G1020	ORIGA-cahaya	PERLINDUNGAN1-VAL	PAPILA

Gunakan Akronim Kasus

Klasifikasi
- BGC = Klasifikasi Glaukoma Biner (sehat vs glaukoma atau non-glaukoma vs glaukoma)
- MGC = Multi Glaucoma Classification (minimal 2 tipe glaukoma, termasuk suspek)
Segmentasi
- ODS = Segmentasi Cakram Optik
- OCS = Segmentasi Piala Optik
- BVS = Segmentasi Pembuluh Darah
- OLS = Segmentasi Lapisan OCT
- RNFLS = Segmentasi Lapisan Serat Saraf Retina
Lainnya
- LT = Tugas Pelokalan
- IQA = Penilaian Kualitas Gambar
- MIDI = Input Domain Multi Gambar
- CDR = Estimasi Rasio Cup-to-Disc
- N = Bentukan
- VF = Informasi/Segmentasi Bidang Visual

Kumpulan Data Gambar Glaukoma Publik

Kumpulan data	Tautan Akses	Aksesibilitas	Label Glaukoma?	Kasus Penggunaan
ACRIMA	https://figshare.com/s/c2d31f850af14c5b5232	membuka	Y	BGC
USIA	https://age.grand-challenge.org/Download/	pendaftaran	Y	MGC, LT
BEH (Rumah Sakit Mata Bangladesh)	https://github.com/mirtanvirislam/Deep-Learning-Based-Glaucoma-Detection-with-Cropped-Optic-Cup-and-Disc-and-Blood-Vessel-Segmentation/tree/master/Dataset	membuka	Y	BGC
BIOMISA	https://data.mendeley.com/datasets/2rnnz5nz74/2	membuka	Y	MGC, BGC, MIDI, OLS, CDR
Chaksu-GAMBAR	https://doi.org/10.6084/m9.figshare.20123135	membuka	Y	BGC
CRFO-v4	https://data.mendeley.com/datasets/trghs22fpg/4	membuka	Y	BGC, MDI, ODS, OCS
DR-HAGIS	https://personalpages.manchester.ac.uk/staff/niall.p.mcloughlin/	membuka	Y	BGC, BVS
DRION-DB	https://www.researchgate.net/publication/326460478_Glaucoma_dataset_-_DRIONS-DB	membuka	N	BODOH
DRISHTI-GS1	https://cvit.iiit.ac.in/projects/mip/drishti-gs/mip-dataset2/Home.php	membuka	Y	BGC, ODS, OCS, CDR, N
EyePACS-AIROGS	https://airogs.grand-challenge.org/data-and-challenge/	membuka	Y	BGC, IQA
EyePACS-AIROGS-cahaya (v1)	https://www.kaggle.com/datasets/deathtrooper/eyepacs-airogs-light	pendaftaran	Y	BGC
EyePACS-AIROGS-cahaya (v2)	https://www.kaggle.com/datasets/deathtrooper/glaucoma-dataset-eyepacs-airogs-light-v2	pendaftaran	Y	BGC
LIMA	https://figshare.com/articles/figure/FIVES_A_Fundus_Image_Dataset_for_AI-based_Vessel_Segmentation/19688169/1	membuka	Y	BGC, BVS
G1020	https://www.kaggle.com/datasets/arnavjain1/glaucoma-datasets	pendaftaran	Y	BGC, ODS, OCS
GAMMA	https://gamma.grand-challenge.org/	pendaftaran	Y	BGC?, ODS, OCS, OLS?, LT, MIDI
SASARAN	https://ichallenges.grand-challenge.org/iChallenge-GON3/	pendaftaran	Y	BGC, OLS
ANGGUR	https://springernature.figshare.com/collections/GRAPE_A_multi-modal_glaucoma_dataset_of_follow-up_visual_field_and_fundus_images_for_glaucoma_management/6406319/1	membuka	Y	MGC, VF
Harvard-GF	https://ophai.hms.harvard.edu/datasets/harvard-glaucoma-fairness-3300-samples/	meminta	N	BGC, VF, RNFLS, MIDI
HRF	https://www5.cs.fau.de/research/data/fundus-images/	membuka	Y
Tes INSPIRE-AVR	https://medicine.uiowa.edu/eye/inspire-datasets	membuka	N
INSPIRE-STEREO	https://medicine.uiowa.edu/eye/inspire-datasets	membuka	N
JSIEC-1000	https://www.kaggle.com/datasets/linchundan/fundusimage1000	pendaftaran	Y
KEH (Rumah Sakit Mata Kim)	https://dataverse.harvard.edu/dataset.xhtml?persistentId=doi:10.7910/DVN/1YRRAC	membuka	Y
KETINGGALAN	https://github.com/smilell/AG-CNN	meminta	Y
LES-AV	https://figshare.com/articles/dataset/LES-AV_dataset/11857698/1	membuka	Y
Leuven-Haifa HRF	https://rdr.kuleuven.be/dataset.xhtml?persistentId=doi:10.48804/Z7SHGO	meminta	Y	MGC, BVS
MSHF	https://www.nature.com/articles/s41597-023-02188-x#ref-CR17	membuka	Y	BGC, IQA
oktv	https://zenodo.org/record/1481223#.Y20g3XbMIuV	membuka	Y
OIA-ODIR	https://www.kaggle.com/datasets/andrewmvd/ocular-disease-recognition-odir5k	pendaftaran	Y
ONHSD	https://aldiri.info/Image%20Datasets/ONHSD.aspx	tidak dapat diakses	Y
ORIGA-cahaya	https://www.kaggle.com/datasets/sshikamaru/glaucoma-detection	pendaftaran	Y
PAPILA	https://doi.org/10.6084/m9.figshare.14798004.v1	membuka	Y
PERLINDUNGAN1	https://refuge.grand-challenge.org/REFUGE2Download/	pendaftaran	Y
PERLINDUNGAN2	https://refuge.grand-challenge.org/REFUGE2Download/	pendaftaran	Y
RIGA-BIN-TERGERAK	https://deepblue.lib.umich.edu/data/concern/data_sets/3b591905z	membuka	N
RIGA-MAGRABI	https://deepblue.lib.umich.edu/data/concern/data_sets/3b591905z	membuka	N
RIGA-MESSIDOR	https://deepblue.lib.umich.edu/data/concern/data_sets/3b591905z	membuka	N
RIM-SATU-r1	http://medimrg.webs.ull.es/research/retinal-imaging/rim-one/	membuka	Y
RIM-SATU-r2	http://medimrg.webs.ull.es/research/retinal-imaging/rim-one/	membuka	Y
RIM-SATU-r3	http://medimrg.webs.ull.es/research/retinal-imaging/rim-one/	membuka	Y
RIM-SATU-DL	http://medimrg.webs.ull.es/research/retinal-imaging/rim-one/	membuka	Y
SIGF	https://github.com/XiaofeiWang2018/DeepGF	meminta	Y
SMDG	https://www.kaggle.com/datasets/deathtrooper/multichannel-glaucoma-benchmark-dataset	pendaftaran	Y
sjchoi86-HRF	https://github.com/yiweichen04/retina_dataset	membuka	Y
VEIRC	https://github.com/ProfMKD/Glaucoma-dataset	membuka	Y