D SCRIPT

D-SKRIP

D-SCRIPT adalah metode pembelajaran mendalam untuk memprediksi interaksi fisik antara dua protein berdasarkan urutannya saja. Ini dapat digeneralisasikan dengan baik pada spesies baru dan tahan terhadap keterbatasan ukuran data pelatihan. Desainnya mencerminkan intuisi bahwa agar dua protein dapat berinteraksi secara fisik, sebagian asam amino dari masing-masing protein harus bersentuhan satu sama lain. Tahap peralihan D-SCRIPT secara langsung mengimplementasikan intuisi ini, dengan tahap kedua dari belakang dalam D-SCRIPT menjadi perkiraan kasar peta kontak antar-protein dimer protein. Desain yang dimotivasi secara struktural ini meningkatkan kemampuan interpretasi hasil dan, karena struktur lebih dilestarikan secara evolusioner dibandingkan urutan, meningkatkan kemampuan generalisasi antar spesies.

• D-SCRIPT dijelaskan dalam makalah “Prediksi interaksi protein-protein berbasis urutan: model pembelajaran mendalam yang dapat ditafsirkan dengan sadar struktur” oleh Sam Sledzieski, Rohit Singh, Lenore Cowen, dan Bonnie Berger.

• Beranda

• Dokumentasi