RAPD
NB - Proyek ini sedang dalam pengembangan dan mutakhir. Kode akan stabil secara signifikan pada Juni 2021.
Paket untuk pengindeksan otomatis, strategi, integrasi, analisis, & solusi struktur data kristalografi makromolekul.
Saat ini kami sedang membangun kemampuan pada baris perintah dan menambahkan detektor ke perangkat lunak.
Perintah saat ini:
- menganalisis - menganalisis kumpulan data MX dan melakukan pdbquery
- get_cif - dapatkan file CIF dari PDB dengan kode 4 karakter
- get_pdb - dapatkan file PDB dari PDB dengan kode 4 karakter
- hdf5_to_cbf - mengonversi file hdf5 ke CBF
- indeks - mengindeks data MX dan menghitung strategi pengumpulan data
- mengintegrasikan - mengintegrasikan data MX
- pdbquery - membandingkan data dengan struktur masukan, kontaminan umum, atau struktur dalam PDB dengan parameter sel satuan yang serupa
Perintah pengembang:
- menghasilkan - membuat file template RAPD baru
- print_detector - mencetak informasi file gambar
- python - python CLI dengan impor RAPD lengkap tersedia
- tes - peserta tes untuk proyek RAPD
- version - mencetak versi RAPD yang diinstal saat ini
- xds_to_dict - mengubah XDS.INP menjadi dict python untuk disertakan dalam file detektor RAPD
Pendeteksi situs saat ini didukung (lebih banyak lagi yang akan datang):
APS
- aps_gmca_dectris_eiger16m
- lscat_dectris_eiger9m
- lscat_rayonix_mx300
- necat_dectris_eiger16m
- necat_dectris_pilatus6mf
- sercat_rayonix_mx300hs
Universitas California
Untuk instruksi tentang instalasi dan pengaturan, lihat install/README.md
