conStruct
v1.0.3
Repo ini berisi kode untuk konstruk metode - alat statistik untuk memodelkan struktur genetik populasi kontinu dan diskrit.
Naskah, file data, dan skrip analisis yang terkait dengan publikasi "menyimpulkan struktur genetik populasi kontinu dan diskrit di seluruh ruang," telah dipindahkan, dan dapat diakses di tautan di bawah ini:
Untuk menginstal rilis terbaru dari paket Construct R:
install.packages( " conStruct " )Setelah instalasi, model konstruk akan dikompilasi, yang dapat meludahkan banyak teks, dan mungkin beberapa peringatan, ke layar Anda. Ini benar -benar normal, dan Anda seharusnya hanya khawatir jika Anda mendapatkan kesalahan dan instalasi gagal.
Untuk menginstal versi pengembangan dari GitHub:
library( devtools )
install_github( " gbradburd/conStruct " , build_vignettes = TRUE )Perhatikan bahwa pengguna Windows mungkin harus mengunduh RTOOLS sebagai mandiri yang dapat dieksekusi sebelum mencoba menginstal paket konstruk R.
Manual lengkap untuk semua fungsi yang terdokumentasi tersedia di sini.
Selain itu, ada empat sketsa yang termasuk dalam paket yang berjalan melalui berbagai langkah dalam pipa analisis secara rinci. Anda dapat menemukannya menggunakan:
# formatting data
vignette( topic = " format-data " , package = " conStruct " )
# how to run a conStruct analysis
vignette( topic = " run-conStruct " , package = " conStruct " )
# how to visualize the output of a conStruct model
vignette( topic = " visualize-results " , package = " conStruct " )
# how to compare and select between different conStruct models
vignette( topic = " model-comparison " , package = " conStruct " )Ada juga contoh file data yang termasuk dalam paket, yang dapat Anda muat menggunakan perintah:
data( conStruct.data )Setelah mengacu pada manual dan sketsa, silakan arahkan semua pertanyaan ke Bradburd (at) umich.edu, atau posting sebagai masalah pada repo git.
