dimple

lesung pipi

Pipa kristalografi makromolekul untuk penyaringan penyempurnaan dan ligan.

Lihat Dokumen di http://ccp4.github.io/dimple

Instalasi

Dimple adalah bagian dari suite CCP4. Semua pekerjaan dilakukan oleh program lain dari suite, yang dijalankan di bawahnya. Yang terpenting adalah Refmac dan Phaser . Jadi, Anda harus menginstal CCP4.

Untuk menguji versi pengembangan terbaru, klon repositori ini dan jalankan ./dimple/dimple .

Dimple hadir dengan sedikit utilitas find-blobs . Jika Anda tidak mengkompilasinya, versi dari suite CCP4 akan digunakan. Kompilasi membutuhkan perpustakaan Clipper yang pada gilirannya membutuhkan MMDB2 dan LIBCCP4. Anda dapat membangun semuanya dari sumber atau menggunakan conda untuk mengunduh binari yang dikompilasi dengan GCC 4.8. Yang terakhir dapat dilakukan dengan memasang miniconda dan melakukan:

 conda install -c mw clipper

Daripada membangun gumpalan yang menunjuk di mana perpustakaan yang diperlukan adalah:

 export CXXFLAGS="-D_GLIBCXX_USE_CXX11_ABI=0 -std=c++98"  # for GCC 5
cmake -D CMAKE_PREFIX_PATH=$HOME/miniconda2 .
make

Tidak perlu membuat instal - biner mendarat di direktori yang sama dengan skrip Python dan Dimple akan menggunakan program dari sini sebagai preferensi dengan yang dari $CCP4/bin .

Jika tidak berhasil - lihat metode kontak di bawah ini.

Komentar?

Setiap pemikiran, komentar, atau umpan balik diterima. Jika tidak berfungsi seperti yang diharapkan atau tidak berhasil sama sekali - beri tahu kami secepatnya. Gunakan pelacak masalah atau email CCP4 Helpdesk atau kirim email ke [email protected] atau.

---

Dibuat di Sumber Cahaya Berlian dan di CCP4-Harwell.