MA_MA_meta

MA_MA_META

Repositori untuk upaya meta-analisis multi-penawaran yang sedang berlangsung di Pusat NIH untuk Alzheimer dan Dementias Terkait (CARD).

Abstrak

Studi asosiasi genome-wide (GWAS) penyakit Alzheimer sebagian besar dilakukan pada individu keturunan Eropa meskipun variasi yang diketahui dalam arsitektur genetik dan prevalensi penyakit di seluruh populasi global. Kami memanfaatkan populasi Hispanik Eropa, Asia Timur, Afrika Timur, Afrika, dan Karibia untuk melakukan meta-analisis GWAS multi-penerima multi-penanggulangan terbesar dari penyakit Alzheimer hingga saat ini. Metode ini memungkinkan kami untuk mengidentifikasi dua lokus terkait penyakit baru yang independen pada kromosom 3. Kami juga memanfaatkan beragam struktur haplotype untuk fine peta sembilan lokus dan secara global menilai heterogenitas faktor risiko yang diketahui di seluruh populasi. Selain itu kami membandingkan generalisasi skor risiko poligenik multi-penanggulangan dan tunggal yang diturunkan pada populasi Kolombia yang dicampur tiga arah. Temuan kami menyoroti pentingnya representasi multi-penanggulangan dalam mengungkap dan memahami faktor-faktor putatif yang berkontribusi pada risiko penyakit Alzheimer.

Tautan ke naskah

1. Pracetak
2. Publikasi TBD

Ringkasan

1. Meta-analisis

   • MR-MEGA: Melakukan meta-analisis multi-penanggulangan menggunakan MR-MEGA V0.2.
   • Efek acak dan tetap: Melakukan multi-penanggulangan efek meta-analisis menggunakan Plink V1.9.

2. Analisis pasca-gwas

   • Mengidentifikasi Loci Novel: Mengidentifikasi lokus yang berpotensi baru dengan membandingkan dengan daftar lokus iklan yang diketahui.
   • Pemetaan halus: Pemetaan halus menggunakan MR-MEGA untuk membuat set yang kredibel 99%.
   • SMR: Pengacakan Mendelian berbasis ringkasan untuk menominasikan gen kerentanan di lokus baru.
   • PRS: Melakukan analisis skor risiko poligenik dan menilai kinerja dengan kurva operator penerima.