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医療

Medicatは、医療画像、キャプション、サブ図サブキャプション注釈、およびインラインテキスト参照のデータセットです。アクセスの指示はこちらから提供されています。

図とキャプションは、PubMed Centralのオープンアクセス記事から抽出され、対応する参照テキストはS2ORCから派生しています。

データセットは次のとおりです。

131,410のオープンアクセス論文からの217,060の数字
2069の複合図の7507サブキャプテンとサブ図アノテーション
Rocoデータセットの約25kの数値のインライン参照

データのサンプルはsample/で利用できます。

データエントリの例：

 {
  "pdf_hash": "57c9ad0f4aab133f96d40992c46926fabc901ffa",
  "fig_key": "Figure1",
  "fig_uri": "2-Figure1-1.png",
  "s2_caption": "Figure 1. (A) Barium enema and (B) endoscopic image of the high-grade distal colonic obstruction caused by a 5-cm anastomotic stricture.",
  "s2orc_caption": "Figure 1. (A) Barium enema and (B) endoscopic image of the high-grade distal colonic obstruction caused by a 5-cm anastomotic stricture.",
  "s2orc_references": [
    "Computed tomography (CT) showed a distal large bowel obstruction, and a barium enema revealed a high-grade stenosis proximal to the anastomotic site in the recto-sigmoid region (Figure 1 ).",
    "Flexible sigmoidoscopy revealed a tight, fibrotic, benign-appearing anastomotic stricture 15 cm from the anal verge ( Figure 1) ."
  ],
  "radiology": false,
  "scope": true,
  "predicted_type": "Medical images",
  "oa_info": {
    "doi": "10.14309/crj.2014.54",
    "doi_url": "https://doi.org/10.14309/crj.2014.54",
    "oa": {
      "is_oa": true,
      "oa_status": "gold",
      "journal_is_oa": true,
      "journal_is_in_doaj": true,
      "license": "cc-by-nc-nd",
      "provenance": "unpaywall"
    }
  }
}

対応する図はfigures/57c9ad0f4aab133f96d40992c46926fabc901ffa_2-Figure1-1.png {pdf_hash}_{fig_uri} ）にあります。

ダウンロードする：

アクセスのためにこのフォームに記入してください。 5日後にデータセットへのリンクを受け取っていない場合は、[email protected]にお問い合わせください。電子メールにアクセスすることもスパムボックスに登場する場合があるため、メールを送信する前に最初に確認してください。

コード

私たちの論文に関連付けられているコードのcodeディレクトリをご覧ください。 code/README.mdには、このコードの使用方法に関する追加情報が含まれています。

引用する：

このデータセットを使用する場合は、引用してください：

 @inproceedings{subramanian-2020-medicat,
    title={{MedICaT: A Dataset of Medical Images, Captions, and Textual References}},
    author={Sanjay Subramanian, Lucy Lu Wang, Sachin Mehta, Ben Bogin, Madeleine van Zuylen, Sravanthi Parasa, Sameer Singh, Matt Gardner, and Hannaneh Hajishirzi},
    year={2020},
    booktitle={Findings of EMNLP},
}

ライセンス

Medicatの各ソースドキュメントは異なる方法でライセンスされています。 Medicatに含まれる記事には、オープンアクセスライセンスがあります（CCおよびUPWを参照）、またはパブリックドメインにあります。各記事のライセンスは、データセットの関連するエントリで提供されます。使用するときは、これらのライセンスを遵守してください。メディカットデータセットは、非営利目的のみで利用できます。