이 작업은 (https://litgene.tumorai.org/)에 배포된 트레일 웹런에 있습니다.
웹페이지의 자체 배포에는 배포 github(https://github.com/vinash85/GENELLM_WEBAPP)을 사용할 수 있습니다.
LitGene 도구 페이지의 피드백 페이지를 사용하거나 작성자에게 연락하여 피드백을 제공하세요.
BioArxiv 링크: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.08.07.606674v1
Docker를 사용하여 샘플 코드를 실행하는 방법은 다음과 같습니다.
도커 빌드:
에이. git clone "cd LitGene/dependent/docker/" 이후 docker 파일 위치로 이동
비. 도커 빌드 "docker build . -t litgene"
Docker 이미지 실행/컨테이너 생성:
기음. "docker run --name Litgene --gpus=all --previleged --ports 8888:8888 -v litgene_location:/home/tailab/LitGene -dit litgene /bin/bash"
도커를 입력하세요:
디. "docker exec -it Litgene /bin/bash"
Docker 내부에서 샘플 코드 용해도로 이동합니다.
이자형. "CD /홈/tailab/LitGene/"
에프. jupyter 열기 " jupyter 노트북 --ports 8888 --ip 0.0.0.0 --allow-root --no-browser"
docker가 배포된 시스템에서:
g. 브라우저 열기 "https://localhost:8888"
시간. 토큰을 입력하세요
나. 샘플 코드 "solubilityEval.ipynb"를 실행하세요.
또는 원격 시스템의 docker(선택 사항):
g. 로컬 시스템에서 명령 열기
시간. "ssh -NL localhost:8888:localhost:8888 usernme@server"를 입력하세요.
나. 5단계를 반복하세요
(LitGene에 제공된 Conda 요구 사항/A100 GPU의 Python 3.12 및 nvidia 드라이버 535.183.01 및 런타임 cuda 12.2를 사용하여 Ubuntu 22에서 테스트된 종속성에 관심이 있는 경우)
code/refactored_code에서 코드 리팩토링이 진행 중입니다. 기타 데이터 파일, 모델 및 출력 파일의 경우. [[email protected]]로 문의해주세요.
