rdkit

RDKit

그것은 무엇입니까?

RDKit은 C++ 및 Python으로 작성된 화학정보학 및 기계 학습 소프트웨어 모음입니다.

• BSD 라이센스 - 비즈니스 친화적인 오픈 소스 라이센스
• C++의 핵심 데이터 구조 및 알고리즘
• Boost.Python을 사용하여 생성된 Python 3.x 래퍼
• SWIG로 생성된 Java 및 C# 래퍼
• 중요한 기능에 대한 JavaScript(emscripten으로 생성됨) 및 CFFI 래퍼
• 2D 및 3D 분자 작업
• 기계 학습을 위한 설명자 및 지문 생성
• 하위 구조 및 유사성 검색은 물론 다양한 설명자 계산기를 지원하는 PostgreSQL용 분자 데이터베이스 카트리지
• KNIME용 화학정보학 노드
• RDKit의 기능을 활용하는 유용한 커뮤니티 기부 소프트웨어가 포함된 Contrib 폴더

설치 및 시작하기

Python으로 작업하고 conda(권장 사항)를 사용하는 경우 설치가 매우 쉽습니다.

 $ conda install -c conda-forge rdkit

그런 다음 Python 시작하기 가이드를 살펴보세요.

더 자세한 설치 지침은 Docs/Book/Install.md에서 확인할 수 있습니다.

선적 서류 비치

RDKit 페이지와 GitHub의 Docs 폴더에서 사용 가능

RDKit 블로그에는 종종 유용한 팁과 요령이 있습니다.

지원 및 커뮤니티

질문, 의견, 제안 사항이 있는 경우 가장 적합한 곳은 다음과 같습니다.

• GitHub 토론
• 메일링 리스트

버그를 발견했거나 기능을 요청하고 싶다면 이슈를 생성해 주세요.

LinkedIn 그룹도 있습니다

우리는 커뮤니티 구성원이 RDKit을 사용하여 수행한 작업에 대해 프레젠테이션과 번개 대화를 나누는 연간 사용자 그룹 회의(UGM)를 개최합니다. 매우 유용할 수 있는 과거 UGM의 자료도 온라인에 있습니다.

• 2012 UGM, 런던
• 2013 UGM, 힌스턴
• 2014 UGM, 다름슈타트
• 2015 UGM, 취리히
• 2016 UGM, 바젤
• 2017 UGM, 베를린
• 2018 UGM, 케임브리지
• 2019 UGM, 함부르크
• 2020 UGM, 가상
• 2021 UGM, 가상
• 2022 UGM, 베를린
• 2023 UGM, 마인츠
• 2024 UGM, 취리히

특허

BSD 라이센스에 따라 공개된 코드입니다.