녹내장 데이터세트 메타데이터

새로운 업데이트

• 08/03/24 : 녹내장 감지에 대한 새로운 접근 방식을 소개하는 새로운 초록이 대중에게 공개되었습니다. 녹내장 감지를 위한 망막 혈관계 평가: 인간 전문 지식과 딥 러닝 알고리즘의 비교 분석.
• 05/15/24 : Kaggle의 EyePACS-light-V2 코드 폴더에는 빠르고 쉬운 녹내장 감지 설정을 위한 새로운 PyTorch 템플릿이 있습니다. 이 모델은 경량 MobileNetV3를 사용하며 92.6%의 테스트 정확도를 달성했습니다: https://www.kaggle.com/code/deathtrooper/pytorch-easy-setup-for-glaucoma-Detection-92-6
• 03/09/24: EyePACS-light-V2는 이제 10.0 Kaggle 유용성 점수를 갖습니다. 보충 메타데이터.csv 파일이 데이터세트에 추가되었습니다.
• 01/20/24 : 데이터 세트가 어떻게 파생되었는지 궁금하다면 이제 Kaggle 데이터 세트 링크의 정보 섹션(아래로 스크롤)에서 EyePACS-light-V2 전처리 상위 수준 개요를 볼 수 있습니다.
• 12/28/23 : ConvNeXtTiny를 사용한 EyePACS-light-V2 94.94% 테스트 정확도 벤치마크: https://www.kaggle.com/code/deathtrooper/benchmark-94-94-convnexttiny
• 12/12/23 : EyePACS-light-V2 출시!!! 이 향상된 데이터 세트를 사용하여 가장 먼저 모델을 벤치마킹해 보세요! Kaggle에서 다운로드: https://www.kaggle.com/datasets/deathtrooper/glaucoma-dataset-eyepacs-airogs-light-v2/data

인용노트

이 카탈로그가 도움이 되었다면 다음 내용을 인용해 보십시오.

• 라일리 키퍼, 무하마드 아비드, 제시카 스틴, 마사 라이시 아르달리, 에산 암자디안. 2023. 기계 학습 애플리케이션을 위한 공개 녹내장 데이터 세트 카탈로그: 망막 안저 이미지 및 OCT 이미지를 사용하여 녹내장 관련 문제를 다루는 기계 학습 엔지니어가 사용할 수 있는 공개 녹내장 데이터 세트에 대한 자세한 설명 및 분석입니다. 2023년 제7회 정보 시스템 및 데이터 마이닝에 관한 국제 컨퍼런스(ICISDM '23) 진행 중. 컴퓨팅 기계 협회, 뉴욕, 뉴욕, 미국, 24–31. https://doi.org/10.1145/3603765.3603779

공개 녹내장 데이터세트 카탈로그

[새로운 녹내장 데이터세트에 대한 링크/출판물을 제공하여 이 저장소를 확장하는 데 도움을 주세요!]

저장소 목차

• README.md : 녹내장 개요, 관련 연구 및 데이터 세트 액세스 링크
• benchmark-eyepacs-airogs-light.md : EyePACS-AIROGS-light 데이터세트의 train/val 세트를 사용한 테스트 세트 평가용 리더보드
• summary.md : 데이터 세트 클래스 분류, 이미지 유형 및 녹내장 유형
• data-availability.md : 데이터 세트 이미지 및 분할 가용성.
• Origin.md : 데이터 세트 수집 원본 및 수집 연도입니다.

녹내장 개요

AAO에 따르면 "녹내장은 눈의 시신경을 손상시키는 질병입니다. 일반적으로 눈 앞쪽에 체액이 쌓일 때 발생합니다. 그 여분의 체액은 눈의 압력을 증가시켜 시신경을 손상시킵니다." 이는 실명의 주요 원인이며 치료하지 않고 방치할 경우 시간이 지남에 따라 악화됩니다. 검안사는 안저 영상(눈의 2D 영상)이나 안구간섭단층촬영(OCT) 영상(눈의 3D 영상)을 통해 녹내장을 진단합니다. 안저 영상에서 검안사는 일반적으로 시신경 컵이나 시신경 유두 손상을 찾습니다. OCT 이미지에서 검안사는 일반적으로 층 위축을 찾습니다. 녹내장 감지를 자동화하기 위해 기계 학습용 데이터 세트가 선별됩니다. 안저 이미지 데이터세트는 일반적으로 건강한 녹내장을 구별하기 위한 녹내장 분류 또는 컵이나 디스크 손상을 추출하고 분석하기 위한 시신경두 분할을 위해 설계되었습니다. EyePACS-AIROGS-light와 같은 고품질 벤치마크 데이터세트에는 재현성을 위해 미리 결정된 열차, 검증 및 테스트 세트가 있습니다.

관련 녹내장 데이터세트(필자)

• SMDG-19 [데이터 세트], "녹내장에 대한 표준화된 다중 채널 데이터 세트, 버전 19", https://www.kaggle.com/datasets/deathtrooper/multichannel-glaucoma-benchmark-dataset
• EyePACS-AIROGS-light-v1 [데이터 세트], "강력한 녹내장 검진 과제를 위한 EyePACS 인공 지능, 경량 버전 1", https://www.kaggle.com/datasets/deathtrooper/eyepacs-airogs-light
• EyePACS-AIROGS-light-v2 [데이터 세트], "강력한 녹내장 검진 과제를 위한 EyePACS 인공 지능, 경량 버전 2", https://www.kaggle.com/datasets/deathtrooper/glaucoma-dataset-eyepacs-airogs-light- v2

관련 녹내장 연구(필자)

• ARVO 2024 [요약], "녹내장 발견을 위한 망막 혈관계 평가: 인간 전문 지식과 딥 러닝 알고리즘의 비교 분석", https://iovs.arvojournals.org/article.aspx?articleid=2794846
• AAO 2022 [요약], "자동 녹내장 감지를 위해 공개적으로 사용 가능한 녹내장 데이터 세트에 대한 종합 조사", https://aaopt.org/past-meeting-abstract-archives/?SortBy=ArticleYear&ArticleType=&ArticleYear=2022&Title=&Abstract=&Authors= &제휴=&PROGRAMNUMBER=225129
• AAO 2023 [Abstract], "녹내장 검출에서 안저 혈관의 예측력", AAO 2023 발표로 채택
• AAO 2023 [Abstract], "EyePACS-light: 자동 녹내장 분류 모델링을 위한 경량 균형 데이터 세트", AAO 2023 포스터로 채택
• ARVO 2023 [요약], "녹내장 탐지를 위한 인공 지능 모델에 활용되는 공개적으로 사용 가능한 데이터 세트의 실측 검증", https://iovs.arvojournals.org/article.aspx?articleid=2791017
• ARVO 2023 [요약], "인공 지능 애플리케이션을 위한 표준화된 개방형 녹내장 데이터 세트", https://iovs.arvojournals.org/article.aspx?articleid=2790420
• IEEE-IEMCOM 2022 [전체 논문], "안저 및 OCT 영상을 이용한 녹내장 검출 알고리즘 조사", https://ieeeexplore.ieee.org/abstract/document/9946629
• IEEE-ICIVC 2023 [전체 논문], "동적 전역 전경 임계값 알고리즘을 사용한 자동화된 안저 이미지 표준화", https://ieeexplore.ieee.org/abstract/document/10270429
• ICISDM 2023 [전체 문서], "기계 학습 애플리케이션을 위한 공개 녹내장 데이터 세트 카탈로그", https://dl.acm.org/doi/abs/10.1145/3603765.3603779

예시 데이터

드리시티-GS	G1020	ORIGA-라이트	REFUGE1-VAL	빠삐라

사용 사례 약어

• 분류
  • BGC = 이분 녹내장 분류(건강한 대 녹내장 또는 비녹내장 대 녹내장)
  • MGC = 다발성 녹내장 분류(의심 대상을 포함하여 최소 2가지 녹내장 유형)
• 분할
  • ODS = 광학 디스크 분할
  • OCS = 광학 컵 분할
  • BVS = 혈관 분할
  • OLS = OCT 레이어 분할
  • RNFLS = 망막 신경 섬유층 분할
• 다른
  • LT = 현지화 작업
  • IQA = 이미지 품질 평가
  • MIDI = 다중 이미지 도메인 입력
  • CDR = 컵 대 디스크 비율 추정
  • N = 노칭
  • VF = 시야 정보/분할

공개 녹내장 이미지 데이터세트

데이터세트	액세스 링크	접근성	녹내장 라벨?	사용 사례
아크리마	https://figshare.com/s/c2d31f850af14c5b5232	열려 있는	와이	BGC
나이	https://age.grand-challenge.org/Download/	등록	와이	MGC, LT
BEH(방글라데시 안과병원)	https://github.com/mirtanvirislam/Deep-Learning-Based-Glaucoma-Detection-with-Cropped-Optic-Cup-and-Disc-and-Blood-Vessel-Segmentation/tree/master/Dataset	열려 있는	와이	BGC
비오미사	https://data.mendeley.com/datasets/2rnnz5nz74/2	열려 있는	와이	MGC, BGC, 미디, OLS, CDR
착수-IMAGE	https://doi.org/10.6084/m9.figshare.20123135	열려 있는	와이	BGC
CRFO-v4	https://data.mendeley.com/datasets/trghs22fpg/4	열려 있는	와이	BGC, MDI, ODS, OCS
DR-HAGIS	https://personalpages.manchester.ac.uk/staff/niall.p.mcloughlin/	열려 있는	와이	BGC, BVS
DRIONS-DB	https://www.researchgate.net/publication/326460478_Glaucoma_dataset_-_DRIONS-DB	열려 있는	N	ODS
드리슈티-GS1	https://cvit.iiit.ac.in/projects/mip/drishti-gs/mip-dataset2/Home.php	열려 있는	와이	BGC, ODS, OCS, CDR, N
EyePACS-AIROGS	https://airogs.grand-challenge.org/data-and-challenge/	열려 있는	와이	BGC, IQA
EyePACS-AIROGS-라이트(v1)	https://www.kaggle.com/datasets/deathtrooper/eyepacs-airogs-light	등록	와이	BGC
EyePACS-AIROGS-라이트(v2)	https://www.kaggle.com/datasets/deathtrooper/glaucoma-dataset-eyepacs-airogs-light-v2	등록	와이	BGC
파이브	https://figshare.com/articles/Figure/FIVES_A_Fundus_Image_Dataset_for_AI-based_Vessel_Segmentation/19688169/1	열려 있는	와이	BGC, BVS
G1020	https://www.kaggle.com/datasets/arnavjain1/glaucoma-datasets	등록	와이	BGC, ODS, OCS
감마	https://gamma.grand-challenge.org/	등록	와이	BGC?, ODS, OCS, OLS?, LT, MIDI
목표	https://ichallenges.grand-challenge.org/iChallenge-GON3/	등록	와이	BGC, OLS
포도	https://springernature.figshare.com/collections/GRAPE_A_multi-modal_glaucoma_dataset_of_follow-up_visual_field_and_fundus_images_for_glaucoma_management/6406319/1	열려 있는	와이	MGC, VF
하버드-GF	https://ophai.hms.harvard.edu/datasets/harvard-glaucoma-fairness-3300-samples/	요구	N	BGC, VF, RNFLS, 미디
HRF	https://www5.cs.fau.de/research/data/fundus-images/	열려 있는	와이
INSPIRE-AVR 테스트	https://medicine.uiowa.edu/eye/inspire-datasets	열려 있는	N
인스파이어-스테레오	https://medicine.uiowa.edu/eye/inspire-datasets	열려 있는	N
JSIEC-1000	https://www.kaggle.com/datasets/linchundan/fundusimage1000	등록	와이
KEH(김안과병원)	https://dataverse.harvard.edu/dataset.xhtml?pertantId=doi:10.7910/DVN/1YRRAC	열려 있는	와이
지연	https://github.com/smilell/AG-CNN	요구	와이
레-AV	https://figshare.com/articles/dataset/LES-AV_dataset/11857698/1	열려 있는	와이
루벤-하이파 HRF	https://rdr.kuleuven.be/dataset.xhtml?pertantId=doi:10.48804/Z7SHGO	요구	와이	MGC, BVS
MSHF	https://www.nature.com/articles/s41597-023-02188-x#ref-CR17	열려 있는	와이	BGC, IQA
옥티비	https://zenodo.org/record/1481223#.Y20g3XbMIuV	열려 있는	와이
OIA-오디르	https://www.kaggle.com/datasets/andrewmvd/cular-disease-recognition-odir5k	등록	와이
ONHSD	https://aldiri.info/Image%20Datasets/ONHSD.aspx	접근할 수 없는	와이
ORIGA-라이트	https://www.kaggle.com/datasets/sshikamaru/glaucoma-Detection	등록	와이
빠삐라	https://doi.org/10.6084/m9.figshare.14798004.v1	열려 있는	와이
피난처1	https://refuge.grand-challenge.org/REFUGE2Download/	등록	와이
피난처2	https://refuge.grand-challenge.org/REFUGE2Download/	등록	와이
리가빈이 달려들었다	https://deepblue.lib.umich.edu/data/concern/data_sets/3b591905z	열려 있는	N
리가-마그라비	https://deepblue.lib.umich.edu/data/concern/data_sets/3b591905z	열려 있는	N
리가-메시도르	https://deepblue.lib.umich.edu/data/concern/data_sets/3b591905z	열려 있는	N
RIM-ONE-r1	http://medimrg.webs.ull.es/research/retinal-imaging/rim-one/	열려 있는	와이
RIM-ONE-r2	http://medimrg.webs.ull.es/research/retinal-imaging/rim-one/	열려 있는	와이
RIM-ONE-r3	http://medimrg.webs.ull.es/research/retinal-imaging/rim-one/	열려 있는	와이
림-원-DL	http://medimrg.webs.ull.es/research/retinal-imaging/rim-one/	열려 있는	와이
시그프	https://github.com/XiaofeiWang2018/DeepGF	요구	와이
SMDG	https://www.kaggle.com/datasets/deathtrooper/multichannel-glaucoma-benchmark-dataset	등록	와이
sjchoi86-HRF	https://github.com/yiweichen04/retina_dataset	열려 있는	와이
베이르크	https://github.com/ProfMKD/Glaucoma-dataset	열려 있는	와이