RAPD
NB - 이 프로젝트는 개발 중이며 최첨단입니다. 코드는 2021년 6월에 크게 안정화될 것입니다.
거대분자 결정학 데이터의 자동화된 인덱싱, 전략, 통합, 분석 및 구조 솔루션을 위한 패키지입니다.
현재 우리는 명령줄에 기능을 구축하고 소프트웨어에 탐지기를 추가하고 있습니다.
현재 명령:
- 분석 - MX 데이터 세트를 분석하고 pdbquery를 수행합니다.
- get_cif - 4자리 코드로 PDB에서 CIF 파일을 가져옵니다.
- get_pdb - 4자리 코드로 PDB에서 PDB 파일을 가져옵니다.
- hdf5_to_cbf - hdf5 파일을 CBF로 변환
- index - MX 데이터 색인화 및 데이터 수집 전략 계산
- 통합 - MX 데이터 통합
- pdbquery - 데이터를 입력 구조, 일반적인 오염 물질 또는 유사한 단위 셀 매개변수가 있는 PDB의 구조와 비교합니다.
개발자 명령:
- 생성 - 새로운 RAPD 템플릿 파일 생성
- print_Detector - 이미지 파일 정보 인쇄
- python - 전체 RAPD 가져오기가 가능한 Python CLI
- 테스트 - RAPD 프로젝트의 테스트 실행기
- version - 현재 설치된 RAPD 버전을 인쇄합니다.
- xds_to_dict - RAPD 탐지기 파일에 포함하기 위해 XDS.INP를 Python dict로 변환합니다.
현재 지원되는 사이트 감지기(추가 지원 예정):
APS
- aps_gmca_dectris_eiger16m
- lscat_dectris_eiger9m
- lscat_rayonix_mx300
- necat_dectris_eiger16m
- necat_dectris_pilatus6mf
- sercat_rayonix_mx300hs
UCLA
설치 및 설정에 대한 지침은 install/README.md를 참조하세요.
