scib reproducibility

scIB 재현성

이 저장소에는 단일 셀 통합 벤치마킹 문서에 제시된 분석을 재현하기 위한 보충 코드가 포함되어 있습니다. scIB 프로젝트의 다른 부분에 대해서는 다음 저장소를 참조하세요.

• scIB 패키지
• scIB 파이프라인
• 연구에 사용된 데이터

일부 보충 결과는 결과 웹사이트(https://theislab.github.io/scib-reproducibility)에서 볼 수 있습니다.

디렉토리 구조

• data/ - 수치 작성에 사용되는 벤치마킹 결과가 포함된 데이터 파일 및 결과 웹사이트
• docs/ - 렌더링된 결과 웹사이트
• notebooks/ - 평가 데이터 세트 및 지표를 준비하는 데 사용되는 Jupyter 노트북입니다.
• scripts/ - 추가 분석 코드
• visualization/ - 그림 및 시각화 생성을 위한 코드
• website/ - 결과 웹사이트를 생성하기 위한 코드