xolotl

Xolotl : 빠르고 유연한 뉴런 시뮬레이터

xolotl 은 C++ 로 작성된 빠른 단일 구획 및 다중 구획 MATLAB 입니다.

xolotl을 사용하는 이유는 무엇입니까? 이것이 이유입니다.

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xolotl은 빠릅니다

Xolotl은 C ++로 작성되었으며 빠릅니다 . 우리의 테스트에서는 단일 구획 뉴런의 경우 뉴런보다 3 배 이상 빠릅니다.

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Xolotl은 사용하기 쉽습니다

Hodgkin-Huxley 모델을 설정하고, 전류를 주입하고, 통합하고, 전압 추적을 플로팅하고 싶습니까? 이것이 필요한 전부입니다.

x = xolotl ;
x .add( ' compartment ' , ' HH ' , ' A ' , 0.01 );
x . HH .add( ' liu/NaV ' , ' gbar ' , 1000 );
x . HH .add( ' liu/Kd ' , ' gbar ' , 300 );
x . HH .add( ' Leak ' , ' gbar ' , 1 );
x.I_ext = .2 ;
x . plot ;

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Xolotl에는 문서가 있습니다

Xolotl은 실제로 존재하는 문서를 가지고 있습니다.

이것은 다음과 같은 것입니다.

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Xolotl은 완전히 프로그래밍 가능 합니다

Xolotl은 MATLAB 내 에서 사용하도록 설계되었습니다. Matlab이 제공하는 모든 도구 상자의 풍부한 전력을 갖춘 C ++ 컴파일 코드의 고성능. 당신은 할 수 있습니다 :

• 모델을 인수로 전달하는 기능을 작성하십시오
• 글로벌 최적화 도구 상자를 사용하여 뉴런 모델의 매개 변수 최적화
• 여러 컴퓨터에서 시뮬레이션을 병렬로 실행하십시오
• 시뮬레이션을 실행하고 결과를 분석 할 단일 스크립트가 있습니다.

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고리? 여기서 시작하십시오.

어디서 얻습니까?

다운로드하려면 여기를 클릭하고 다운로드 된 파일을 클릭하여 설치하십시오.

이것을 어떻게 인용합니까?

우리는 Neuroinformatics의 Frontiers에 기술 보고서를 발표했습니다.

 @ARTICLE{10.3389/fninf.2018.00087,
AUTHOR={Gorur-Shandilya, Srinivas and Hoyland, Alec and Marder, Eve},   
TITLE={Xolotl: An Intuitive and Approachable Neuron and Network Simulator for Research and Teaching},      
JOURNAL={Frontiers in Neuroinformatics},      
VOLUME={12},      
PAGES={87},     
YEAR={2018},      
URL={https://www.frontiersin.org/article/10.3389/fninf.2018.00087},       
DOI={10.3389/fninf.2018.00087},      
ISSN={1662-5196},   
}

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