conStruct

구성 (연속 구조) readme

이 repo에는 연속적이고 개별 인구 유전자 구조를 모델링하기위한 통계 도구 인 메소드 구성 코드가 포함되어 있습니다.

"공간을 가로 질러 지속적이고 개별적 인 집단 유전자 구조를 추론하는"출판물과 관련된 원고, 데이터 파일 및 분석 스크립트가 이동되었으며 아래 링크에서 액세스 할 수 있습니다.

• 종이
• 원고 repo
• Data Dryad

설치

최신 릴리스

Construct R 패키지의 가장 최근 릴리스를 설치하려면 :

install.packages( " conStruct " )

설치하면 구성 모델이 컴파일되어 화면에 많은 텍스트와 일부 경고를 뱉을 수 있습니다. 이것은 완전히 정상이며 오류가 발생하고 설치가 실패한 경우에만 걱정해야합니다.

개발 버전

GitHub에서 개발 버전을 설치하려면 :

	library( devtools )
	install_github( " gbradburd/conStruct " , build_vignettes = TRUE )

Windows 사용자는 Construct R 패키지를 설치하기 전에 RTools를 독립형 실행 파일로 다운로드해야 할 수도 있습니다.

시작하기

문서화 된 모든 기능에 대한 완전한 매뉴얼은 여기에서 제공됩니다.

또한 패키지에는 분석 파이프 라인의 다양한 단계를 자세히 살펴 보는 4 개의 비 네트가 있습니다. 다음을 사용하여 찾을 수 있습니다.

 # formatting data
	vignette( topic = " format-data " , package = " conStruct " )

# how to run a conStruct analysis
	vignette( topic = " run-conStruct " , package = " conStruct " )

# how to visualize the output of a conStruct model
	vignette( topic = " visualize-results " , package = " conStruct " )

# how to compare and select between different conStruct models
	vignette( topic = " model-comparison " , package = " conStruct " )

패키지에 포함 된 예제 데이터 파일도 있습니다. 여기에는 명령을 사용하여로드 할 수 있습니다.

	data( conStruct.data )

연락하다

수동 및 비네팅을 참조한 후 모든 쿼리를 Bradburd (at) Umich.edu로 지시하거나 GIT Repo의 문제로 게시하십시오.