dimple

보조개

정제 및 리간드 스크리닝을위한 거대 분자 결정학 파이프 라인.

http://ccp4.github.io/dimple의 문서를 참조하십시오

설치

딤플은 CCP4 스위트의 일부입니다. 모든 작업은 그 아래에서 실행되는 스위트의 다른 프로그램에 의해 수행됩니다. 가장 중요한 것은 RefMac 과 Phaser입니다 . 따라서 CCP4를 설치해야합니다.

최신 개발 버전을 테스트하려면이 저장소를 복제하고 ./dimple/dimple 실행하십시오.

Dimple에는 약간의 find-blobs 유틸리티가 제공됩니다. 컴파일하지 않으면 CCP4 제품군의 버전이 사용됩니다. 컴파일에는 Clipper 라이브러리가 필요하므로 MMDB2 및 LIBCCP4가 필요합니다. GCC 4.8로 컴파일 된 Binaries를 다운로드하기 위해 Conda를 사용하여 모든 것을 구축 할 수 있습니다. 후자는 Miniconda를 설치하고 수행하여 수행 할 수 있습니다.

 conda install -c mw clipper

필요한 라이브러리가있는 위치를 가리키는 구조 블로 브를 빌드하는 것보다 :

 export CXXFLAGS="-D_GLIBCXX_USE_CXX11_ABI=0 -std=c++98"  # for GCC 5
cmake -D CMAKE_PREFIX_PATH=$HOME/miniconda2 .
make

Make 설치가 필요하지 않습니다 - 이진은 Python 스크립트와 동일한 디렉토리에 착륙했으며 Dimple은 여기에서 $CCP4/bin 의 프로그램을 선호하는 프로그램을 사용합니다.

작동하지 않으면 아래의 연락처 방법을 참조하십시오.

댓글?

모든 생각, 의견 또는 피드백을 환영합니다. 예상대로 작동하지 않거나 전혀 작동하지 않으면 최대한 빨리 알려주십시오. 문제 추적기 또는 이메일 CCP4 HelpDesk 또는 이메일 [email protected] 또는 이메일을 사용하십시오.

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다이아몬드 광원 및 CCP4-Harwell로 제작되었습니다.