cromwell
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Cromwell é um sistema de gerenciamento de fluxo de trabalho de código aberto para bioinformática. O licenciamento é BSD de 3 cláusulas.
A documentação do Cromwell possui um site dedicado.
Primeira vez em Cromwell? Comece com os tutoriais.
Pensando em contribuir para Cromwell? Comece lendo nosso Guia do Colaborador.
Cromwell tem um ecossistema crescente de projetos apoiados pela comunidade para tornar a sua experiência ainda melhor! Confira nossa página Ecossistema para saber mais.
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Muitos usuários hoje executam seus fluxos de trabalho WDL no Terra, uma plataforma de bioinformática em nuvem gerenciada com suporte WDL integrado fornecido pela Cromwell. Veja aqui um guia de início rápido.
Usuários com necessidades especializadas que desejam instalar e manter suas próprias instâncias Cromwell podem baixar uma imagem JAR ou Docker. A equipe de desenvolvimento aceita relatórios de bugs reproduzíveis de instâncias autogerenciadas, mas não pode fornecer suporte direto de maneira viável.
Os back-ends da Cromwell recebem recursos de desenvolvimento proporcionais à demanda do usuário. A equipe está desenvolvendo ativamente para Google Cloud e Microsoft Azure (consulte Cromwell no Azure). A manutenção de outros back-ends é principalmente baseada na comunidade.
Cromwell oferece suporte à linguagem de fluxo de trabalho WDL. O Cromwell versão 80 e superior não oferece mais suporte a CWL.
O CWL será reintroduzido posteriormente na plataforma Terra, utilizando uma solução diferente do Cromwell. Consulte a postagem do blog "Roteiro do Terra para oferecer suporte a mais linguagens de fluxo de trabalho" para obter detalhes.
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