Перейдите на сайт NCBI: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/.
Найдите свой организм, как показано на предмет Fusarium в красном прямоугольном прямоугольнике на рис. 1.
Результаты поиска будут отображаться в разных категориях (рис. 1).
Нажмите на базу данных Genomes, как показано красным шестиугольником на рис. 1.
Рисунок 1: Найдите свой организм в базе данных NCBI.
Вы увидите что-то вроде рис. 2.
Поставьте галочку в поле сборки, как показано красным кружком на рис. 2.
Нажмите вкладку «Выбрать столбцы» , как показано красным прямоугольником на рис. 2.
Рисунок 2. Выберите интересующие вас метаданные.
Рисунок 3: Доступные метаданные.
Нажмите вкладку «Загрузка», как показано красным кружком на рис. 4.
В раскрывающемся меню выберите «Загрузить таблицу».
Выберите формат значений, разделенных табуляцией (TSV).
Нажмите «Загрузить».
Рисунок 4. Загрузите метаданные.
Будет загружен файл TSV, содержащий метаданные.
Вы можете открыть файл TSV в Excel, как показано на рис. 5.
Рисунок 5: Лист метаданных.
Теперь у вас есть лист Excel, содержащий метаданные всех доступных последовательностей генома Fusarium.
Вы можете отсортировать эту информацию и составить краткий список номеров сборок, которые вы хотите загрузить.
См. это руководство о том, как автоматически загружать последовательности генома:
https://github.com/asadprodhan/How-to-download-all-the-available-genome-sequences-of-an-organism-automatically
