Этот репозиторий содержит исходный код CCBuilder 2. Доступ к работающему приложению можно получить здесь.
Построение и оптимизация моделей в CCBuilder 2.0 осуществляется на базе ISAMBARD. Если вы хотите выполнить построение модели в более крупном масштабе или если вы хотите построить более сложные модели спиральных спиралей, коллагенов или других параметризуемых белковых складок, вы можете использовать ISAMBARD непосредственно на своем локальном вычислительном ресурсе. Доступен широкий спектр документации и учебных материалов, которые помогут вам начать работу.
Любая публикация, связанная с использованием пакета CCBuilder, должна содержать следующую ссылку:
Вуд К.В. и Вульфсон Д.Н. (2017) CCBuilder 2.0: Мощное и доступное спиральное моделирование, Protein Science . дои: 10.1002/pro.3279
Я больше не являюсь членом группы Woolfson, но по-прежнему активно поддерживаю CCBuilder 2. Если у вас есть какие-либо вопросы по поводу приложения, свяжитесь со мной: