Это репозиторий для пакета R с инструментами управления данными и визуализацией для GPS и данных акселерометра для отслеживания животных (например, коров). Включает два блестящих приложения для визуализации и анализа соответствующих пространственных временных данных.
Пожалуйста, обратитесь к Руководству по PDF для подробной информации об использовании функций.
Приложение Animal Tracker поставляется с демонстрационными данными. Или, удобно загрузите свои собственные файлы данных животных. Для приложения есть возможность фильтровать плохие точки данных после загрузки файлов. Вы можете настроить параметры фильтрации и опционально кластер с помощью алгоритма кластеризации Калмана.
По умолчанию поиск высоты ограничен максимальной/минимальной широтой и долготой, определенной при анализе загруженных данных, но границы могут быть изменены вручную. Эти границы также влияют на кластеризацию Калмана из меню фильтрации. Аналогичным образом, уровень масштабирования по умолчанию по умолчанию на текущий масштаб карты, но также может быть изменен вручную на значения с 1-14. Нажмите на флажки, чтобы включить наклон и аспект с возвышением.
Используйте выпадающие выборы для фильтра по сайту, животным или диапазону дат. Функции приложения будут динамически обновляться на основе вашего выбора, а фильтрованные данные также доступны в качестве загрузки.
Кроме того, трекер животных может визуализировать местность из данных ваших животных. Переключайте между просмоткой точки и тепловой карты или накладывайте оба. Нарисуйте прямоугольник, чтобы выбрать конкретную область.
Animal Tracker также визуализирует и сравнивает поведение ваших животных. Графики включают в себя высоту со временем животными и количество точек в выборке по животным, а также скорость перемещения по животным и общее время, проведенное по местоположению (не показано).
Приложение поставляется со статистической сводной утилитой для дополнения визуализации. Выберите между повышением, разницей во времени между измерениями GPS, курсом, разницей в курсе между измерениями GPS, расстоянием и скоростью для обобщения. Затем выберите из размера выборки, среднего, среднего, стандартного отклонения, дисперсии, минимального значения, максимального значения, диапазона, межквартильного диапазона, первого квартиля и статистики третьего квартиля.
Сравните и визуализируйте два набора данных рядом с приложением проверки. Попробуйте приложение с включенными демонстрационными наборами или загрузите свои собственные файлы .csv (.txt еще не поддерживается).
Обнаружение выбросов также может быть применено. В настоящее время мы поддерживаем модифицированную классификацию Z-оценки в соответствии с Iglewicz и Hoaglin (1993).
Кроме того, сводная статистика предоставляется для отмеченных данных из обнаружения выбросов приложения или метода, уже применяемый к данным перед загрузкой.
Это приложение может быть установлено и запустить через rStudio (или базовую консоль R).
Перед установкой трекера для животных убедитесь, что у вас установлен и загруженный пакет DevTools:
install.packages("devtools")
library(devtools)
Установите и загрузите AnimalTracker, выполнив следующее:
install_github("mathedjoe/animaltracker")
library(animaltracker)
Запустите приложение Core Shiny, выполнив следующее:
run_shiny_animaltracker()
Запустите валидационное приложение Shiny, выполнив следующее:
run_validation_app()
Напишите [email protected].
