Скачать medicat - Загрузка исходного кода medicat

medicat

Другой исходный код

1.0.0

Скачать

Медик

Medicat-это набор данных медицинских изображений, подписей, аннотаций Subfigure-Subcaption и встроенных текстовых ссылок. Инструкции для доступа представлены здесь.

Рисунки и подписи извлечены из статей с открытым доступом в PubMed Central, а соответствующий эталонный текст получен из S2ORC.

Набор данных состоит из:

217 060 рисунок из 131 410 документов с открытым доступом
7507 аннотации подкапления и субфигура для 2069 составных рисунков
Встроенные ссылки для цифр ~ 25K в наборе данных ROCO

Образец данных доступен в sample/ .

Пример ввода данных:

 {
  "pdf_hash": "57c9ad0f4aab133f96d40992c46926fabc901ffa",
  "fig_key": "Figure1",
  "fig_uri": "2-Figure1-1.png",
  "s2_caption": "Figure 1. (A) Barium enema and (B) endoscopic image of the high-grade distal colonic obstruction caused by a 5-cm anastomotic stricture.",
  "s2orc_caption": "Figure 1. (A) Barium enema and (B) endoscopic image of the high-grade distal colonic obstruction caused by a 5-cm anastomotic stricture.",
  "s2orc_references": [
    "Computed tomography (CT) showed a distal large bowel obstruction, and a barium enema revealed a high-grade stenosis proximal to the anastomotic site in the recto-sigmoid region (Figure 1 ).",
    "Flexible sigmoidoscopy revealed a tight, fibrotic, benign-appearing anastomotic stricture 15 cm from the anal verge ( Figure 1) ."
  ],
  "radiology": false,
  "scope": true,
  "predicted_type": "Medical images",
  "oa_info": {
    "doi": "10.14309/crj.2014.54",
    "doi_url": "https://doi.org/10.14309/crj.2014.54",
    "oa": {
      "is_oa": true,
      "oa_status": "gold",
      "journal_is_oa": true,
      "journal_is_in_doaj": true,
      "license": "cc-by-nc-nd",
      "provenance": "unpaywall"
    }
  }
}

Соответствующий рисунок расположен на figures/57c9ad0f4aab133f96d40992c46926fabc901ffa_2-Figure1-1.png ( {pdf_hash}_{fig_uri} ).

Для скачивания:

Пожалуйста, заполните эту форму для доступа. Если вы не получили ссылки на набор данных через 5 дней, пожалуйста, свяжитесь с [email protected], чтобы узнать. Иногда доступ к электронным письмам также попадает в спам -коробки, поэтому, пожалуйста, проверьте там сначала перед отправкой по электронной почте.

Код

Пожалуйста, смотрите каталог code для кода, связанного с нашей статьей. code/README.md включает в себя дополнительную информацию о том, как вы можете использовать этот код.

Цитировать:

При использовании этого набора данных, пожалуйста, укажите:

 @inproceedings{subramanian-2020-medicat,
    title={{MedICaT: A Dataset of Medical Images, Captions, and Textual References}},
    author={Sanjay Subramanian, Lucy Lu Wang, Sachin Mehta, Ben Bogin, Madeleine van Zuylen, Sravanthi Parasa, Sameer Singh, Matt Gardner, and Hannaneh Hajishirzi},
    year={2020},
    booktitle={Findings of EMNLP},
}

Лицензия

Каждый исходный документ в Medicat имеет лицензию по -разному. Статьи, включенные в Medicat, имеют лицензии на открытый доступ (см. CC и UPW) или находятся в общественном доступе. Лицензия для каждой статьи приведена в связанной записи в наборе данных. Пожалуйста, соблюдайте эти лицензии при использовании. Набор данных Medicat доступен только для некоммерческого использования.