D SCRIPT

D-SCRIPT

D-SCRIPT เป็นวิธีการเรียนรู้เชิงลึกสำหรับการทำนายปฏิสัมพันธ์ทางกายภาพระหว่างโปรตีนสองชนิดที่ได้รับเพียงลำดับของมัน สามารถใช้ได้กับสายพันธุ์ใหม่ๆ ได้ดี และทนทานต่อข้อจำกัดในขนาดข้อมูลการฝึก การออกแบบนี้สะท้อนให้เห็นถึงสัญชาตญาณที่ว่าเพื่อให้โปรตีนสองตัวมีปฏิกิริยากันทางกายภาพ ชุดย่อยของกรดอะมิโนจากโปรตีนแต่ละชนิดควรจะสัมผัสกัน ระยะกลางของ D-SCRIPT ปรับใช้สัญชาตญาณนี้โดยตรง โดยระยะสุดท้ายใน D-SCRIPT เป็นการประมาณคร่าวๆ ของแผนผังการสัมผัสระหว่างโปรตีนของไดเมอร์โปรตีน การออกแบบที่มีแรงจูงใจเชิงโครงสร้างนี้ช่วยเพิ่มความสามารถในการตีความของผลลัพธ์ และเนื่องจากโครงสร้างได้รับการอนุรักษ์เชิงวิวัฒนาการมากกว่าลำดับ จึงช่วยปรับปรุงความสามารถทั่วไปในสายพันธุ์ต่างๆ

• D-SCRIPT ได้รับการอธิบายไว้ในบทความเรื่อง “การทำนายปฏิกิริยาระหว่างโปรตีนและโปรตีนตามลำดับ: โมเดลการเรียนรู้เชิงลึกที่เข้าใจโครงสร้างที่ตีความได้” โดย Sam Sledzieski, Rohit Singh, Lenore Cowen และ Bonnie Berger

• หน้าแรก

• เอกสารประกอบ