tower cli ดาวน์โหลด - tower cli ดาวน์โหลดซอร์สโค้ด

tower cli

ซอร์สโค้ดอื่น ๆ

v0.10.3

ดาวน์โหลด

สอง CLI

tw คือแพลตฟอร์ม Seqera บนบรรทัดคำสั่ง โดยนำแนวคิดของ Seqera เช่น ไปป์ไลน์ การดำเนินการ และสภาพแวดล้อมการประมวลผลมาสู่เทอร์มินัล

Seqera Platform เป็นแอปพลิเคชันแบบฟูลสแตกสำหรับการจัดการไปป์ไลน์ข้อมูลและทรัพยากรการประมวลผล ช่วยให้สามารถวิเคราะห์ข้อมูลร่วมกันในขนาด ภายในองค์กร หรือในระบบคลาวด์ใดก็ได้

CLI โต้ตอบกับ Seqera เพื่อจัดเตรียมอินเทอร์เฟซสำหรับเปิดใช้ไปป์ไลน์ จัดการทรัพยากรบนคลาวด์ และจัดการการวิเคราะห์ของคุณ

ทวิ

คุณสมบัติที่สำคัญคือ:

ประสบการณ์ที่เหมือน Nextflow : tw CLI มอบสภาพแวดล้อมที่เป็นมิตรต่อนักพัฒนา ไปป์ไลน์สามารถเปิดใช้งานได้ด้วย CLI เช่นเดียวกับ Nextflow แต่มีประโยชน์ของ Seqera ในการตรวจสอบ การบันทึก การจัดเตรียมทรัพยากร การจัดการชุดข้อมูล และการแบ่งปันร่วมกัน
โครงสร้างพื้นฐานเป็นโค้ด : ทรัพยากร Seqera ทั้งหมด รวมถึงไปป์ไลน์และสภาพแวดล้อมการประมวลผล สามารถอธิบายได้ในลักษณะที่เปิดเผย ซึ่งช่วยให้สามารถกำหนดเวอร์ชันที่สมบูรณ์ของสภาพแวดล้อมการวิเคราะห์ที่สามารถกำหนดเวอร์ชันและถือเป็นโค้ดได้ ช่วยลดความยุ่งยากในการแชร์การกำหนดค่าและการดูแลระบบตามปกติอย่างมาก
สร้างขึ้นบน OpenAPI : tw CLI โต้ตอบกับ Seqera ผ่าน Seqera Platform API ซึ่งใช้ข้อกำหนด OpenAPI 3.0 CLI ให้การควบคุมแอปพลิเคชัน Seqera เต็มรูปแบบ ทำให้ผู้ใช้สามารถรับข้อมูลเชิงลึกสูงสุดเกี่ยวกับการส่งไปป์ไลน์และสภาพแวดล้อมการดำเนินการ

ดูเอกสารประกอบแพลตฟอร์ม Seqera เพื่อเรียนรู้เพิ่มเติมเกี่ยวกับแอปพลิเคชัน

ความพร้อมใช้งาน

tw CLI สามารถติดตั้งได้บน macOS, Windows และ Linux

เข้ากันได้กับ Seqera Cloud และ Enterprise เวอร์ชัน 21.08 และใหม่กว่า

เริ่มต้นใช้งาน

คู่มือนี้ครอบคลุมถึงการติดตั้งและการกำหนดค่า CLI การจัดเตรียมโครงสร้างพื้นฐานระบบคลาวด์ และการเปิดใช้งานไปป์ไลน์ในสภาพแวดล้อมการประมวลผล AWS Batch

1. การติดตั้ง

ดาวน์โหลดเวอร์ชันล่าสุดสำหรับระบบปฏิบัติการของคุณจากเนื้อหาในหน้าเผยแพร่
เปลี่ยนชื่อและทำให้ไฟล์ปฏิบัติการได้:
```
mv tw- * tw
chmod +x ./tw
```
ย้ายไฟล์ไปยังไดเร็กทอรีที่สามารถเข้าถึงได้โดยตัวแปร $PATH ของคุณ:
```
sudo mv tw /usr/local/bin/
```

2. การกำหนดค่า

คุณต้องมีโทเค็นการเข้าถึงสำหรับ CLI เพื่อโต้ตอบกับอินสแตนซ์ Seqera ของคุณ เลือก โทเค็นผู้ใช้ จากเมนูผู้ใช้ใน Seqera UI จากนั้นเลือก เพิ่มโทเค็น เพื่อสร้างโทเค็นใหม่

คัดลอกค่าโทเค็นการเข้าถึงและใช้กับ CLI ด้วยวิธีใดวิธีหนึ่งจากสองวิธี:

ตัวแปรสภาพแวดล้อม :
1. ส่งออกโทเค็นเป็นตัวแปรเชลล์ไปยังเทอร์มินัลของคุณโดยตรง:
```
 export TOWER_ACCESS_TOKEN= < your access token >
```
2. เพิ่มคำสั่ง export ไปยังไฟล์ .bashrc , .zshrc หรือ .bash_profile ของคุณเพื่อเพิ่มลงในสภาพแวดล้อมของคุณอย่างถาวร
แฟล็กคำสั่ง tw :
ระบุโทเค็นการเข้าถึงโดยตรงในคำสั่ง tw ของคุณด้วย --access-token :
```
tw --access-token= < your access token > < other options >
```

หากจำเป็น ให้กำหนดค่าตัวแปรสภาพแวดล้อมที่ไม่บังคับต่อไปนี้โดยใช้วิธีการเดียวกันข้างต้น:

TOWER_WORKSPACE_ID : รหัสพื้นที่ทำงาน ค่าเริ่มต้น: พื้นที่ทำงานของผู้ใช้
TOWER_API_ENDPOINT : URL ของ Seqera API ค่าเริ่มต้น: api.cloud.seqera.io

คุณสามารถค้นหา TOWER_WORKSPACE_ID ของคุณได้จากแท็บ พื้นที่ทำงาน ในหน้าองค์กรของคุณ หรือคุณสามารถแสดงรายการพื้นที่ทำงานทั้งหมดที่โทเค็นของคุณสามารถเข้าถึงได้ด้วย tw workspaces list และคัดลอก ID พื้นที่ทำงานจากเอาต์พุตคำสั่ง

3. ตรวจสุขภาพ

ยืนยันการติดตั้ง การกำหนดค่า และการเชื่อมต่อ:

$ tw info

    System health status
    ---------------------------------------+------------------
     Remote API server connection check    | OK
     Tower API version check               | OK
     Authentication API credential's token | OK

คำสั่ง `tw` CLI

ดูการใช้งานสำหรับคำแนะนำโดยละเอียดในการใช้ CLI

การเติมข้อความอัตโนมัติ

เปิดใช้งานการเติมข้อความอัตโนมัติในเซสชันปัจจุบันของคุณด้วยคำสั่งนี้:

 source <( tw generate-completion )

ที่เก็บผู้ออกใบรับรอง SSL แบบกำหนดเอง

หากคุณใช้ใบรับรอง CA SSL ส่วนตัวที่ไม่ได้รับการยอมรับจากผู้ออกใบรับรอง Java เริ่มต้น ให้ใช้ที่เก็บ cacerts แบบกำหนดเอง:

tw -Djavax.net.ssl.trustStore=/absolute/path/to/cacerts info

คุณสามารถเปลี่ยนชื่อไบนารีเป็น tw-binary และสร้างสคริปต์ tw เพื่อรวมที่เก็บ cacerts ที่กำหนดเองในทุกเซสชันโดยอัตโนมัติ:

 #! /usr/bin/env bash
tw-binary -Djavax.net.ssl.trustStore=/absolute/path/to/cacerts $@

สร้างเวอร์ชันการพัฒนาไบนารี

tw CLI เป็นแพลตฟอร์มปฏิบัติการไบนารีที่สร้างขึ้นโดยการคอมไพล์เนทิฟจาก Java GraalVM ในการรวบรวมและสร้างเวอร์ชันการพัฒนาของไบนารี่:

หากจำเป็น ให้ติดตั้ง SDKMan!
จากรูทของโปรเจ็กต์ tower-cli ให้ติดตั้ง GraalVM:
```
sdk env install
```
เพื่อให้แน่ใจว่า SDKMan ใช้การกำหนดค่า .sdkmanrc เฉพาะโปรเจ็กต์ tower-cli
ติดตั้ง native-image :
```
gu install native-image
```
ส่งออกข้อมูลรับรอง Github ของคุณ Github ต้องการการรับรองความถูกต้องสำหรับแพ็คเกจสาธารณะ (โทเค็นต้องการเฉพาะขอบเขต read:packages ):
```
 export GITHUB_USERNAME=...
export GITHUB_TOKEN=...
```

สร้างไคลเอ็นต์ดั้งเดิม:

./gradlew nativeCompile

สิ่งนี้จะติดตั้ง tw เวอร์ชันที่คอมไพล์ในเครื่องในไดเร็กทอรี NativeCompile:

 Produced artifacts:
 <tower-cli-repository-root>/build/native/nativeCompile/tw (executable)
========================================================================================================================
Finished generating 'tw' in 1m 6s.
[native-image-plugin] Native Image written to: <tower-cli-repository-root>/build/native/nativeCompile

BUILD SUCCESSFUL in 1m 8s
6 actionable tasks: 2 executed, 4 up-to-date