lyprox

lyprox คืออะไร?

เป็นเว็บแอป Django ที่แสดงรูปแบบโดยละเอียดของการแพร่กระจายของน้ำเหลืองในมะเร็งศีรษะและคอ และช่วยให้สามารถสำรวจชุดข้อมูลพื้นฐานโดยละเอียดได้ โฮสต์ภายใต้ URL https://lyprox.org

แรงจูงใจ

HNSCC แพร่กระจายผ่านระบบน้ำเหลืองที่คอและก่อให้เกิดการแพร่กระจายในต่อมน้ำเหลืองในภูมิภาค สามารถตรวจพบการแพร่กระจายขนาดมหึมาด้วยวิธีการถ่ายภาพเช่นการสแกน MRI, PET และ CT จากนั้นจึงรวมไว้ในปริมาตรเป้าหมาย เมื่อเลือกการรักษาด้วยรังสีเป็นส่วนหนึ่งของการรักษา อย่างไรก็ตาม การแพร่กระจายของกล้องจุลทรรศน์มีขนาดเล็กเกินไปที่จะวินิจฉัยด้วยเทคนิคการถ่ายภาพในปัจจุบัน

เพื่ออธิบายการมีส่วนร่วมในระดับจุลภาคนี้ ระบบน้ำเหลืองบางส่วนมักถูกฉายรังสีโดยเลือกเพื่อเพิ่มการควบคุมเนื้องอก ส่วนใดบ้างที่รวมอยู่ในปริมาณเป้าหมายทางคลินิกแบบเลือกนี้ ในปัจจุบันมีการตัดสินใจตามหลักเกณฑ์ ^{1 2 3 4} สิ่งเหล่านี้ได้มาจากรายงานความชุกของการมีส่วนร่วมต่อระดับต่อมน้ำเหลือง (LNL) กล่าวคือ ส่วนของผู้ป่วยที่ได้รับการวินิจฉัยว่ามีการแพร่กระจายใน LNL ที่กำหนด โดยแบ่งชั้นตามตำแหน่งของเนื้องอกหลัก ขอแนะนำให้รวม LNL ไว้ในปริมาณเป้าหมายที่เลือก หากผู้ป่วย 10 - 15% แสดงการมีส่วนร่วมในระดับนั้น

อย่างไรก็ตาม ในขณะที่รายงานความชุกของการมีส่วนร่วมในวรรณกรรม ^{5 6} และเส้นทางการระบายน้ำเหลืองโดยทั่วไปเป็นที่เข้าใจกันดี รูปแบบการลุกลามโดยละเอียดของ HNSCC ยังคงมีปริมาณต่ำ เราเชื่อว่าความเสี่ยงในการมีส่วนร่วมด้วยกล้องจุลทรรศน์ใน LNL นั้นขึ้นอยู่กับการวินิจฉัยที่เฉพาะเจาะจงของผู้ป่วยแต่ละรายเป็นอย่างมาก และการรักษาของพวกเขาจึงสามารถเป็นรายบุคคลได้หากรูปแบบการลุกลามมีปริมาณที่ดีกว่า

เป้าหมายของเรา

ด้วยอินเทอร์เฟซหลัก เรามุ่งหวังที่จะทำให้ชุดข้อมูลที่แยกออกมาของเราเข้าถึงได้ง่ายเป็นหลัก ด้วยการเห็นภาพแบบโต้ตอบ เราสามารถทดสอบหรือตั้งสมมติฐานเกี่ยวกับการแพร่กระจายของน้ำเหลืองของ HNSCC ได้อย่างรวดเร็ว หวังว่าสิ่งนี้จะกระตุ้นให้นักวิจัยคนอื่นๆ ตรวจสอบสมมติฐานเหล่านี้ ดึงข้อมูลและแบ่งปันข้อมูลเพิ่มเติมในรายละเอียดที่คล้ายคลึงกัน

สิ่งนี้จะช่วยให้เรา (หรือใครก็ตามจริงๆ) สามารถสร้างแบบจำลองการลุกลามของเนื้องอกที่แม่นยำและแม่นยำยิ่งขึ้น เช่น งานก่อนหน้านี้เกี่ยวกับการใช้เครือข่ายแบบเบย์เพื่อทำนายความน่าจะเป็นส่วนบุคคลของการมีส่วนร่วม ⁷ หรือการตีพิมพ์ล่าสุดของเราในประเด็นนี้โดยใช้แบบจำลองมาร์คอฟที่ซ่อนอยู่ และด้วยเหตุนี้จึงแนะนำวิธีการสร้างแบบจำลองเวลาที่ชัดเจน ⁸

ชุดข้อมูลของรูปแบบการลุกลามของน้ำเหลือง

ข้อมูลที่แสดงเป็นภาพในอินเทอร์เฟซนี้อาศัยอยู่ในพื้นที่เก็บข้อมูลโอเพ่นซอร์สด้วยตัวมันเอง: lyDATA

นอกจากนี้เรายังได้ตีพิมพ์บทความเกี่ยวกับชุดข้อมูลและอินเทอร์เฟซใน Radiotherapy & Oncology ⁹ โดยมีการพิมพ์ล่วงหน้าบน medRxiv ¹⁰

โมเดลความน่าจะเป็นสำหรับคำจำกัดความ CTV ส่วนบุคคล

นอกจากนี้เรายังศึกษาแบบจำลองความน่าจะเป็น ^{7 8} ที่อาจทำนายการแพร่กระจายของน้ำเหลืองของมะเร็งศีรษะและคอ รหัสที่ซ่อนอยู่นั้นโฮสต์อยู่ในที่เก็บอื่น: น้ำเหลือง

วิธีการมีส่วนร่วม

คุณสามารถมีส่วนร่วมในโครงการนี้ได้สองวิธี:

1. หากคุณเป็นนักวิจัยทางคลินิกในสาขานี้และต้องการแบ่งปันข้อมูลของคุณกับเรา โปรดติดต่อเราผ่านทางอีเมล: [email protected]
2. อีกวิธีหนึ่งคือการมีส่วนร่วมในพื้นที่เก็บข้อมูลนี้ เช่น หากคุณเป็นนักพัฒนาซอฟต์แวร์ ฉันเดาว่านี่ไม่น่าจะเป็นไปได้ เนื่องจากขอบเขตที่เฉพาะเจาะจงของแอป Django นี้ แต่เรายังคงยินดีรับความช่วยเหลือใดๆ ก็ตาม ในกรณีนี้ คุณสามารถดูเอกสารรายละเอียดของซอร์สโค้ดได้ที่หน้า GitHub

เรียกใช้อินเทอร์เฟซนี้ในเครื่อง

หากคุณต้องการโฮสต์ข้อมูลของคุณเองหรือลองใช้ข้อมูลของคุณดูในเว็บแอปโดยไม่ต้องทำการอัปโหลด โปรดปฏิบัติตามคำแนะนำเหล่านี้เพื่อเริ่มต้นและรันบนเครื่องของคุณ

เชิงอรรถ

1. Vincent Grégoire และคนอื่นๆ การเลือกและการวิเคราะห์ปริมาตรเป้าหมายของต่อมน้ำเหลืองในการฉายรังสีรักษาตามรูปแบบศีรษะและคอ ข้อเสนอเพื่อกำหนดมาตรฐานคำศัพท์และหัตถการโดยพิจารณาจากประสบการณ์การผ่าตัด รังสีรักษาและมะเร็งวิทยา ปีที่ 1 56, หน้า 135-150, 2000, ดอย: https://doi.org/10.1016/S0167-8140(00)00202-4.

2. Vincent Grégoire, A. Eisbruch, M. Hamoir และ P. Levendag, ข้อเสนอสำหรับการวิเคราะห์ CTV ที่สำคัญในโหนดบวกและคอหลังการผ่าตัด , รังสีบำบัดและมะเร็งวิทยา , ฉบับที่ 79, ไม่ใช่. 1 หน้า 15-20 เม.ย. 2549 ดอย: https://doi.org/10.1016/j.radonc.2006.03.009

3. Vincent Grégoire และคณะ การวิเคราะห์ระดับโหนดคอสำหรับเนื้องอกที่ศีรษะและคอ: อัปเดตปี 2013 แนวทางฉันทามติของ DAHANCA, EORTC, HKNPCSG, NCIC CTG, NCRI, RTOG, TROG , รังสีบำบัดและมะเร็งวิทยา ฉบับที่ 110 ไม่ใช่ 1 หน้า 172-181 ม.ค. 2014 ดอย: https://doi.org/10.1016/j.radonc.2013.10.010

4. Julian Biau และคณะ การเลือกปริมาตรเป้าหมายของต่อมน้ำเหลืองสำหรับการรักษาด้วยรังสีศีรษะและคอขั้นสุดท้าย: อัปเดตปี 2019 รังสีบำบัดและมะเร็งวิทยา ฉบับที่ 134 หน้า 1-9 พฤษภาคม 2019 ดอย: https://doi.org/10.1016/j.radonc.2019.01.018

5. จาติน. P. Shah, FC Candela และ AK Poddar, รูปแบบของการแพร่กระจายของต่อมน้ำเหลืองที่ปากมดลูกจากมะเร็ง squamous ของช่องปาก , มะเร็ง , ฉบับที่ 66 ไม่ใช่ 1, หน้า 109-113, 1990, ดอย: https://doi.org/10.1002/1097-0142(19900701)66:1%3C109::AID-CNCR2820660120%3E3.0.CO;2-A.

6. Laurence Bauwens และคณะ ความชุกและการแพร่กระจายของการแพร่กระจายของมะเร็งต่อมน้ำเหลืองที่ปากมดลูกในมะเร็งเซลล์สความัส oropharyngeal squamous ของ HPV-positive และ HPV- negative 157 หน้า 122-129 เม.ย. 2021 ดอย: https://doi.org/10.1016/j.radonc.2021.01.028

7. Bertrand Pouymayou, P. Balermpas, O. Riesterer, M. Guckenberger และ J. Unkelbach แบบจำลองเครือข่ายแบบเบย์ของการลุกลามของเนื้องอกน้ำเหลืองสำหรับคำจำกัดความ CTV แบบเลือกเฉพาะบุคคลในมะเร็งศีรษะและ คอ ฟิสิกส์การแพทย์และชีววิทยา ฉบับที่ 64, ไม่ใช่. 16 น. 165003 ส.ค. 2019 ดอย: https://doi.org/10.1088/1361-6560/ab2a18 ↩ ↩ ²

8. Roman Ludwig, B. Pouymayou, P. Balermpas และ J. Unkelbach, แบบจำลอง Markov ที่ซ่อนอยู่สำหรับการลุกลามของเนื้องอกน้ำเหลืองในศีรษะและคอ , Sci Rep , vol. 11, ไม่ใช่. 1, น. 12261 ธ.ค. 2021 ดอย: https://doi.org/10.1038/s41598-021-91544-1 ↩ ↩ ²

9. Roman Ludwig และคณะ การรายงานโดยละเอียดของผู้ป่วย-รายบุคคลเกี่ยวกับการมีส่วนร่วมของต่อมน้ำเหลืองในมะเร็งเซลล์สความัสในช่องปากด้วยอินเทอร์เฟซออนไลน์ , รังสีรักษาและมะเร็งวิทยา ก.พ. 2022, ดอย: https://doi.org/10.1016/j.radonc.2022.01 .035.

10. โรมัน ลุดวิก, เจ.-เอ็ม. Hoffmann, B. Pouymayou et al., การรายงานโดยละเอียดของผู้ป่วย-รายบุคคลเกี่ยวกับการมีส่วนร่วมของต่อมน้ำเหลืองในมะเร็งเซลล์ squamous oropharyngeal ด้วยอินเทอร์เฟซออนไลน์ , medRxiv , ธ.ค. 2021 doi: https://doi.org/10.1101/2021.12.01.21267001