หน้าแรก>การเขียนโปรแกรมที่เกี่ยวข้อง>ซอร์สโค้ดอื่น ๆ
ดาวน์โหลด

ร่อง

MacRomolecular Crystallography Pipeline สำหรับการปรับแต่งและการคัดกรองแกนด์

ดูเอกสารที่ http://ccp4.github.io/dimple

การติดตั้ง

Dimple เป็นส่วนหนึ่งของชุด CCP4 งานทั้งหมดทำโดยโปรแกรมอื่น ๆ จากห้องสวีทซึ่งทำงานอยู่ข้างใต้ สิ่งสำคัญที่สุดคือ refmac และ phaser ดังนั้นคุณต้องติดตั้ง CCP4

เพื่อทดสอบเวอร์ชันการพัฒนาล่าสุดโคลนที่เก็บนี้และเรียกใช้ ./dimple/dimple dimple

Dimple มาพร้อมกับ Utility find-blobs เล็กน้อย หากคุณไม่รวบรวมเวอร์ชันจากชุด CCP4 จะถูกใช้ การรวบรวมต้องใช้ไลบรารี Clipper ซึ่งต้องใช้ MMDB2 และ LIBCCP4 คุณสามารถสร้างทุกอย่างได้จากแหล่งที่มาหรือใช้ Conda เพื่อดาวน์โหลดไบนารีที่รวบรวมด้วย GCC 4.8 หลังสามารถทำได้โดยการติดตั้ง miniconda และทำ: 

 conda install -c mw clipper

กว่า build find-blobs ชี้ไปที่ห้องสมุดที่ต้องการ: 

 export CXXFLAGS="-D_GLIBCXX_USE_CXX11_ABI=0 -std=c++98"  # for GCC 5
cmake -D CMAKE_PREFIX_PATH=$HOME/miniconda2 .
make

ไม่จำเป็นต้องติดตั้ง - ไบนารีลงจอดในไดเรกทอรีเดียวกับสคริปต์ Python และ Dimple จะใช้โปรแกรมจากที่นี่เพื่อตั้งค่าจาก $CCP4/bin

หากไม่ได้ผล - ดูวิธีการติดต่อด้านล่าง

ความคิดเห็น?

ยินดีต้อนรับความคิดความคิดเห็นหรือข้อเสนอแนะ หากไม่ได้ผลตามที่คาดไว้หรือไม่ทำงานเลย - แจ้งให้เราทราบโดยเร็ว ใช้ตัวติดตามปัญหาหรืออีเมล CCP4 Helpdesk หรืออีเมล [email protected] หรือ

ผลิตในแหล่งกำเนิดแสงเพชรและใน CCP4-Harwell

ขยาย
ข้อมูลเพิ่มเติม
แอปที่เกี่ยวข้อง
แนะนำสำหรับคุณ
ข้อมูลที่เกี่ยวข้อง ทั้งหมด