MA_MA_meta

ma_ma_meta

ที่เก็บข้อมูลสำหรับการวิเคราะห์อภิมานหลายครั้งอย่างต่อเนื่องที่ศูนย์ NIH สำหรับอัลไซเมอร์และสมองเสื่อมที่เกี่ยวข้อง (CARD)

เชิงนามธรรม

การศึกษาความสัมพันธ์ทั่วทั้งจีโนม (GWAS) ของโรคอัลไซเมอร์นั้นดำเนินการเป็นส่วนใหญ่ในบรรพบุรุษของชาวยุโรปแม้จะมีการเปลี่ยนแปลงที่รู้จักกันดีในสถาปัตยกรรมทางพันธุกรรมและความชุกของโรคในประชากรโลก เราใช้ประโยชน์จากการตีพิมพ์และ de novo gwas จากยุโรปเอเชียตะวันออกแอฟริกันอเมริกันและประชากรฮิสแปนิกแคริบเบียนเพื่อดำเนินการวิเคราะห์อภิมาน Gwas meta-analysis ของโรคอัลไซเมอร์ที่ใหญ่ที่สุดจนถึงปัจจุบัน วิธีนี้ช่วยให้เราสามารถระบุตำแหน่งที่เกี่ยวข้องกับโรคที่เกี่ยวข้องกับโรคใหม่สองแห่งในโครโมโซม 3 นอกจากนี้เรายังใช้ประโยชน์จากโครงสร้าง haplotype ที่หลากหลายไปยังตำแหน่งที่ดีเก้าตำแหน่งและประเมินความหลากหลายของปัจจัยเสี่ยงที่รู้จักทั่วทั้งประชากร นอกจากนี้เรายังเปรียบเทียบความสามารถทั่วไปของคะแนนความเสี่ยงโพลีจีนิกที่ได้จากการเรียนรู้แบบหลายครั้งและแบบเดียวในประชากรโคลอมเบียสามทาง การค้นพบของเราเน้นถึงความสำคัญของการเป็นตัวแทนหลายครั้งในการเปิดเผยและทำความเข้าใจปัจจัยสมมุติที่นำไปสู่ความเสี่ยงของโรคอัลไซเมอร์

ลิงก์ไปยังต้นฉบับ

1. พิมพ์ล่วงหน้า
2. สิ่งพิมพ์ TBD

ภาพรวม

1. การวิเคราะห์อภิมาน

   • MR-MEGA: การวิเคราะห์อภิมานหลายครั้งโดยใช้ MR-MEGA V0.2
   • เอฟเฟกต์แบบสุ่มและคงที่: การทำเอฟเฟกต์แบบคงที่และการวิเคราะห์แบบสุ่มโดยใช้ PLINK V1.9

2. การวิเคราะห์โพสต์-ก๊าซ

   • การระบุตำแหน่งนวนิยาย: การระบุตำแหน่งที่อาจเป็นนวนิยายโดยเปรียบเทียบกับรายการของตำแหน่งโฆษณาที่รู้จัก
   • การทำแผนที่ละเอียด: การทำแผนที่อย่างละเอียดโดยใช้ MR-MEGA เพื่อสร้างชุดที่น่าเชื่อถือ 99%
   • SMR: การสุ่มตัวอย่าง Mendelian โดยสรุปเพื่อเสนอชื่อยีนที่มีความไวต่อความอ่อนแอที่ตำแหน่งนวนิยาย
   • PRS: การวิเคราะห์คะแนนความเสี่ยงโพลีจีนิกและประเมินประสิทธิภาพด้วยเส้นโค้งตัวควบคุมตัวรับสัญญาณ