การตรวจหามะเร็งตั้งแต่เนิ่นๆ เป็นกุญแจสำคัญในการเพิ่มความอยู่รอดของผู้ป่วย แต่เทคโนโลยีที่มีอยู่ถูกท้าทายจากความไวและความจำเพาะที่ไม่เพียงพอ วิธีการหลายวิธีอาศัยการตรวจสอบแบบรุกรานหรือมีอัตราผลบวกลวงสูง ซึ่งจำกัดการใช้งานอย่างแพร่หลาย ในช่วงไม่กี่ปีที่ผ่านมา เทคโนโลยีการตรวจชิ้นเนื้อของเหลวได้รับความสนใจอย่างมาก เนื่องจากไม่มีการรุกราน แต่ข้อจำกัดในการจัดลำดับแบบกำหนดเป้าหมายเชิงลึกก็ได้จำกัดการพัฒนาเช่นกัน
การตรวจพบตั้งแต่เนิ่นๆ ถือเป็นปัญหาที่ยุ่งยากเสมอในกระบวนการรักษามะเร็ง ในช่วงไม่กี่ปีที่ผ่านมา เทคโนโลยีการตรวจชิ้นเนื้อของเหลวได้รับความสนใจอย่างกว้างขวาง เนื่องจากไม่รุกรานและมีความไวสูง อย่างไรก็ตาม เทคโนโลยีการตรวจจับที่มีอยู่ส่วนใหญ่อาศัยการจัดลำดับแบบกำหนดเป้าหมายเชิงลึก และเป็นเรื่องยากที่จะรวมข้อมูลหลายประเภท ซึ่งส่งผลต่อความไวและความจำเพาะ
เพื่อตอบสนองต่อข้อบกพร่องทางเทคนิคนี้ ทีมวิจัยจากมหาวิทยาลัยออกซ์ฟอร์ดได้พัฒนาวิธีการตรวจหา DNA ของเนื้องอกที่หมุนเวียนหลายรูปแบบ (ctDNA) ใหม่ โดยอาศัยการหาลำดับไพริดีนโบเรน (TAPS) ที่ได้รับความช่วยเหลือจาก TET ทั่วทั้งจีโนม จุดเด่นที่สุดของวิธีนี้คือสามารถวิเคราะห์ข้อมูลจีโนมและเมทิลเลชั่นได้พร้อมกัน ทำให้ความไวในการวินิจฉัยโรคมะเร็งสูงถึง 94.9% และความจำเพาะสูงถึง 88.8% เทคโนโลยีที่ก้าวล้ำนี้มอบความเป็นไปได้ใหม่ๆ สำหรับการตรวจคัดกรองมะเร็งตั้งแต่เนิ่นๆ และการแบ่งชั้นผู้ป่วย
การศึกษาชื่อ "TAPS ทั้งจีโนมที่ปราศจากเซลล์หลายเซลล์มีความละเอียดอ่อนและเผยให้เห็นสัญญาณมะเร็งที่จำเพาะ" ได้รับการตีพิมพ์ในวารสาร "Nature Communications" เมื่อวันที่ 8 มกราคม พ.ศ. 2568 ภูมิหลังการวิจัยแสดงให้เห็นว่า แม้ว่าการตรวจหามะเร็งตั้งแต่เนิ่นๆ มีความสำคัญอย่างยิ่งต่อการปรับปรุงการพยากรณ์โรคของผู้ป่วย แต่วิธีการตรวจคัดกรองในปัจจุบันสามารถครอบคลุมมะเร็งได้น้อยกว่า 30% เท่านั้น และหลายวิธีจำเป็นต้องมีการตรวจแบบรุกรานและได้รับการยอมรับต่ำ แม้ว่าเทคโนโลยีการตรวจหามะเร็งหลายชนิดตั้งแต่เนิ่นๆ จะสามารถตรวจพบแบบไม่รุกรานได้ แต่อัตราผลบวกลวงมักจะสูงในผู้ที่ไม่มีอาการ ซึ่งจำกัดการใช้งาน
เทคโนโลยี TAPS ของทีมอ็อกซ์ฟอร์ดใช้วิธีการแบบไม่ทำลายเพื่อรักษาความไวสูงที่เนื้อหา ctDNA ต่ำ นักวิจัยได้ตรวจสอบความถูกต้องของวิธีการนี้ในมะเร็งหลายประเภทโดยการจัดลำดับตัวอย่างเชิงลึกจากผู้ป่วยมะเร็ง 61 รายและกลุ่มควบคุมที่ไม่ใช่มะเร็ง 30 ราย
ทีมงานยังได้พัฒนาไปป์ไลน์การวิเคราะห์ข้อมูลหลายรูปแบบที่รวมการเปลี่ยนแปลงของจำนวนสำเนา การกลายพันธุ์ทางร่างกาย และสัญญาณเมทิลเลชั่น เพื่อปรับปรุงความไวของการตรวจจับ ctDNA ผลลัพธ์แสดงให้เห็นว่าในตัวอย่างนี้ ความไวในการตรวจจับของวิธีนี้สูงถึง 85.2% ซึ่งสูงกว่าผลลัพธ์ของการใช้ข้อมูลเพียงวิธีเดียวมาก
แม้ว่าวิธีการนี้แสดงให้เห็นถึงข้อได้เปรียบที่สำคัญในการตรวจหามะเร็งในระยะเริ่มแรกและการติดตามหลังการผ่าตัด แต่ก็ยังเผชิญกับความท้าทายในการใช้งานจริง เช่น ต้นทุนในการจัดลำดับที่สูง และการตั้งค่าทางคลินิกที่มีทรัพยากรจำกัด การศึกษาในอนาคตสามารถเพิ่มประสิทธิภาพเทคโนโลยีการหาลำดับต่อไปได้ เพื่อขยายการนำไปประยุกต์ใช้กับมะเร็งประเภทต่างๆ ได้มากขึ้น
การวิจัยโดยทีมงานมหาวิทยาลัยอ็อกซ์ฟอร์ดนี้นำมาซึ่งความหวังใหม่ในการตรวจหามะเร็งในระยะเริ่มแรก และความไวและความจำเพาะสูงของการวิจัยนี้จะเป็นรากฐานที่มั่นคงสำหรับการวินิจฉัยและการรักษามะเร็งที่แม่นยำยิ่งขึ้นในอนาคต แม้ว่าความท้าทายยังคงมีอยู่ แต่ความก้าวหน้าในเทคโนโลยีนี้จะทำให้การรักษาโรคมะเร็งก้าวหน้าและนำคุณประโยชน์มาสู่ผู้ป่วยมากขึ้นอย่างไม่ต้องสงสัย