เกม Atomic Heart มีตอนจบที่แตกต่างกันหลายแบบขึ้นอยู่กับตัวเลือกของผู้เล่นในเนื้อเรื่อง ต่อไปนี้เป็นการแนะนำเงื่อนไขที่กระตุ้นและเนื้อหาเฉพาะของตอนจบที่แตกต่างกัน เรื่องราวเส้นทางการพัฒนา
คู่มือตอนจบของ Atomic Heart ฉบับสมบูรณ์
1. ผู้เล่นจะต้องเผชิญกับทางเลือกทางศีลธรรมเมื่อใกล้จบเกม หากพวกเขาเลือกที่จะช่วย BOSS ก่อนที่จะต่อสู้กับฝาแฝด ตอนจบคือการเอาชีวิตรอดและหลบหนี ถือเป็นตอนจบที่ดี
2. ตอนจบที่แย่คือการต่อสู้กับฝาแฝด และคุณจะได้รับเบาะแสของพล็อตเรื่องมากขึ้นในบทสนทนา แต่ในท้ายที่สุดมันเป็นพล็อตการฆ่าที่ถุงมือใช้ และชาร์ลส์ซึ่งเป็นโพลีเมอร์พิเศษของถุงมือคือ ผู้บงการอยู่เบื้องหลัง;
3. จากการวิเคราะห์โครงเรื่องที่ทราบกันในปัจจุบันสรุปได้ว่าหุ่นยนต์แฝดบรรจุจิตสำนึกของภรรยาตัวเอกเนื่องจากอุบัติเหตุ สมองซีกซ้ายและซีกขวาจึงถูกแยกออกเป็นสองซีก และแพทย์ก็แปลงร่างเป็นแฝด ความจำของตัวเอกได้รับการแก้ไข และทั้ง Glove AI และคุณหมออาจจะใช้ประโยชน์จากตัวเอก
ข้างต้นเป็นการแนะนำเนื้อเรื่องของตอนจบทั้งสองในเกมในปัจจุบัน หากมีการปล่อย DLC ใหม่ในภายหลัง เนื้อหาเนื้อเรื่องใหม่อาจถูกเพิ่มเข้ามา