青光眼数据集元数据

新更新

• 24 年 8 月 3 日：新的摘要向公众开放，介绍了一种青光眼检测的新方法：青光眼检测的视网膜血管评估：人类专业知识和深度学习算法的比较分析。
• 24 年 5 月 15 日：Kaggle 上的 EyePACS-light-V2 代码文件夹有一个新的 PyTorch 模板，用于快速、轻松地设置青光眼检测。该模型使用轻量级的MobileNetV3，测试准确率达到92.6%：https://www.kaggle.com/code/deathtrooper/pytorch-easy-setup-for-glaucoma-detection-92-6
• 24 年 3 月 9 日：EyePACS-light-V2 现在的 Kaggle 可用性评分为 10.0：补充的metadata.csv 文件已添加到数据集。
• 24 年 1 月 20 日：如果您对数据集的衍生方式感到好奇，现在可以在“关于”部分（一直向下滚动）的 Kaggle 数据集链接上获取 EyePACS-light-V2 预处理高级概述
• 23 年 12 月 28 日：使用 ConvNeXtTiny 的 EyePACS-light-V2 94.94% 测试精度基准：https://www.kaggle.com/code/deathtrooper/benchmark-94-94-convnexttiny
• 23 年 12 月 12 日：EyePACS-light-V2 就在这里！！！成为第一个使用这个改进的数据集对您的模型进行基准测试的人！从kaggle下载：https://www.kaggle.com/datasets/deathtrooper/glaucoma-dataset-eyepacs-airogs-light-v2/data

引文注释

如果您发现本目录有帮助，请考虑引用以下内容：

• 莱利·基弗、穆罕默德·阿比德、杰西卡·斯蒂恩、马赫萨·雷西·阿达利和埃桑·阿姆贾迪安。 2023. 用于机器学习应用的公共青光眼数据集目录：对公共青光眼数据集的详细描述和分析，可供机器学习工程师使用视网膜眼底图像和 OCT 图像解决青光眼相关问题。 2023 年第七届国际信息系统和数据挖掘会议 (ICISDM '23) 论文集。计算机协会，美国纽约州纽约市，24-31。 https://doi.org/10.1145/3603765.3603779

公共青光眼数据集目录

[通过提供新青光眼数据集的链接/出版物来帮助扩展此存储库！]

存储库目录

• README.md：青光眼概述、相关研究和数据集访问链接
• benchmark-eyepacs-airogs-light.md ：使用 EyePACS-AIROGS-light 数据集的训练/验证集进行测试集评估的排行榜
• summary.md ：数据集类别细分、图像类型和青光眼类型
• data-availability.md ：数据集图像和分割可用性。
• origin.md ：数据集收集来源和收集年份。

青光眼概述

根据 AAO 的说法，“青光眼是一种损害眼睛视神经的疾病。它通常发生在眼睛前部积聚液体时。多余的液体会增加眼睛的压力，从而损害视神经”。它是导致失明的主要原因，如果不及时治疗，情况会随着时间的推移而恶化。验光师通过眼底图像（眼睛的 2D 图像）或眼相干断层扫描 (OCT) 图像（眼睛的 3D 图像）来诊断青光眼。在眼底图像中，验光师通常会寻找视杯或视盘损伤。在 OCT 图像中，验光师通常会寻找层萎缩。为了自动检测青光眼，我们为机器学习整理了数据集。眼底图像数据集通常设计用于青光眼分类以区分健康的青光眼或视神经乳头分割以提取和分析视杯或视盘损伤。 EyePACS-AIROGS-light 等高质量基准数据集具有预先确定的训练、验证和测试集，以实现可重复性。

相关青光眼数据集（由我提供）

• SMDG-19 [数据集]，“青光眼标准化多通道数据集，版本 19”，https://www.kaggle.com/datasets/deathtrooper/multichannel-glaucoma-benchmark-dataset
• EyePACS-AIROGS-light-v1 [数据集]，“EyePACS 人工智能用于稳健的青光眼筛查挑战，轻量级版本 1”，https://www.kaggle.com/datasets/deathtrooper/eyepacs-airogs-light
• EyePACS-AIROGS-light-v2 [数据集]，“EyePACS 人工智能用于稳健的青光眼筛查挑战，轻量级版本 2”，https://www.kaggle.com/datasets/deathtrooper/glaucoma-dataset-eyepacs-airogs-light- v2

相关青光眼研究（我做）

• ARVO 2024 [摘要]，“青光眼检测的视网膜脉管系统评估：人类专业知识和深度学习算法的比较分析”，https://iovs.arvojournals.org/article.aspx?articleid=2794846
• AAO 2022 [摘要]，“用于自动青光眼检测的公开青光眼数据集的综合调查”， https://aaopt.org/past-meeting-abstract-archives/?SortBy=ArticleYear&ArticleType=&ArticleYear=2022&Title=&Abstract=&Authors=&Affiliation=&PROGRAMNUMBER=225129
• AAO 2023 [摘要]，“眼底血管在青光眼检测中的预测能力”，被接受为 AAO 2023 的演讲
• AAO 2023 [摘要]，“EyePACS-light：用于自动青光眼分类建模的轻量级平衡数据集”，被接受为 AAO 2023 海报
• ARVO 2023 [摘要]，“用于青光眼检测的人工智能模型中使用的公开数据集的地面实况验证”，https://iovs.arvojournals.org/article.aspx?articleid=2791017
• ARVO 2023 [摘要]，“用于人工智能应用的标准化和开放访问青光眼数据集”，https://iovs.arvojournals.org/article.aspx?articleid=2790420
• IEEE-IEMCOM 2022 [全文]，“使用眼底和 OCT 图像的青光眼检测算法的调查”，https://ieeexplore.ieee.org/abstract/document/9946629
• IEEE-ICIVC 2023 [全文]，“使用动态全局前景阈值算法实现自动眼底图像标准化”，https://ieeexplore.ieee.org/abstract/document/10270429
• ICISDM 2023 [全文]，“机器学习应用的公共青光眼数据集目录”，https://dl.acm.org/doi/abs/10.1145/3603765.3603779

示例数据

德里什蒂-GS	G1020	ORIGA-光	避难所1-VAL	帕皮拉

用例首字母缩略词

• 分类
  • BGC = 青光眼二元分类（健康与青光眼或非青光眼与青光眼）
  • MGC = 多种青光眼分类（至少 2 种青光眼类型，包括疑似青光眼）
• 分割
  • ODS = 视盘分割
  • OCS = 视杯分割
  • BVS = 血管分割
  • OLS = OCT 层分割
  • RNFLS = 视网膜神经纤维层分割
• 其他
  • LT = 本地化任务
  • IQA = 图像质量评估
  • MIDI = 多图像域输入
  • CDR = 杯盘比估计
  • N = 开槽
  • VF = 视野信息/分割

公共青光眼图像数据集

数据集	访问链接	无障碍	青光眼标签？	使用案例
阿克瑞玛	https://figshare.com/s/c2d31f850af14c5b5232	打开	是	巴格达公司
年龄	https://age.grand-challenge.org/Download/	登记	是	MGC、LT
BEH（孟加拉国眼科医院）	https://github.com/mirtanvirislam/Deep-Learning-Based-Glaucoma-Detection-with-Cropped-Optic-Cup-and-Disc-and-Blood-Vessel-Segmentation/tree/master/Dataset	打开	是	巴格达公司
比奥米萨	https://data.mendeley.com/datasets/2rnnz5nz74/2	打开	是	MGC、BGC、MIDI、OLS、CDR
查克苏图像	https://doi.org/10.6084/m9.figshare.20123135	打开	是	巴格达公司
CRFO-v4	https://data.mendeley.com/datasets/trghs22fpg/4	打开	是	BGC、MDI、ODS、OCS
DR-HAGIS	https://personalpages.manchester.ac.uk/staff/niall.p.mcloughlin/	打开	是	BGC、BVS
DRIONS数据库	https://www.researchgate.net/publication/326460478_Glaucoma_dataset__-_DRIONS-DB	打开	氮	消耗臭氧层物质
德里什蒂-GS1	https://cvit.iiit.ac.in/projects/mip/drishti-gs/mip-dataset2/Home.php	打开	是	BGC、ODS、OCS、CDR、N
EyePACS-AIROGS	https://airogs.grand-challenge.org/data-and-challenge/	打开	是	BGC、IQA
EyePACS-AIROGS-light (v1)	https://www.kaggle.com/datasets/deathtrooper/eyepacs-airogs-light	登记	是	巴格达公司
EyePACS-AIROGS-light (v2)	https://www.kaggle.com/datasets/deathtrooper/glaucoma-dataset-eyepacs-airogs-light-v2	登记	是	巴格达公司
五人组	https://figshare.com/articles/figure/FIVES_A_Fundus_Image_Dataset_for_AI-based_Vessel_Segmentation/19688169/1	打开	是	BGC、BVS
G1020	https://www.kaggle.com/datasets/arnavjain1/glaucoma-datasets	登记	是	BGC、ODS、OCS
伽玛	https://gamma.grand-challenge.org/	登记	是	BGC?、ODS、OCS、OLS?、LT、MIDI
目标	https://ichallenges.grand-challenge.org/iChallenge-GON3/	登记	是	BGC、OLS
葡萄	https://springernature.figshare.com/collections/GRAPE_A_multi-modal_glaucoma_dataset_of_follow-up_visual_field_and_fundus_images_for_glaucoma_management/6406319/1	打开	是	MGC、心室颤动
哈佛-GF	https://ophai.hms.harvard.edu/datasets/harvard-glaucoma-fairness-3300-samples/	要求	氮	BGC、VF、RNFLS、MIDI
热辐射	https://www5.cs.fau.de/research/data/fundus-images/	打开	是
INSPIRE-AVR-测试	https://medicine.uiowa.edu/eye/inspire-datasets	打开	氮
灵感立体声	https://medicine.uiowa.edu/eye/inspire-datasets	打开	氮
JSIEC-1000	https://www.kaggle.com/datasets/linchundan/fundusimage1000	登记	是
KEH（金氏眼科医院）	https://dataverse.harvard.edu/dataset.xhtml?persistentId=doi:10.7910/DVN/1YRRAC	打开	是
落后	https://github.com/smilell/AG-CNN	要求	是
左旋AV	https://figshare.com/articles/dataset/LES-AV_dataset/11857698/1	打开	是
鲁汶-海法 HRF	https://rdr.kuleuven.be/dataset.xhtml?persistentId=doi:10.48804/Z7SHGO	要求	是	MGC、BVS
MSHF	https://www.nature.com/articles/s41597-023-02188-x#ref-CR17	打开	是	BGC、IQA
华侨电视台	https://zenodo.org/record/1481223#.Y20g3XbMIuV	打开	是
奥迪尔	https://www.kaggle.com/datasets/andrewmvd/ eyes-disease-recognition-odir5k	登记	是
国家卫生健康局	https://aldiri.info/Image%20Datasets/ONHSD.aspx	难以接近的	是
ORIGA-光	https://www.kaggle.com/datasets/sshikamaru/glaucoma-detection	登记	是
帕皮拉	https://doi.org/10.6084/m9.figshare.14798004.v1	打开	是
避难所1	https://refuge.grand-challenge.org/REFUGE2Download/	登记	是
避难所2	https://refuge.grand-challenge.org/REFUGE2Download/	登记	是
里加-宾-拉什德	https://deepblue.lib.umich.edu/data/concern/data_sets/3b591905z	打开	氮
里加-马格拉比	https://deepblue.lib.umich.edu/data/concern/data_sets/3b591905z	打开	氮
里加-梅西多尔	https://deepblue.lib.umich.edu/data/concern/data_sets/3b591905z	打开	氮
RIM-ONE-r1	http://medimrg.webs.ull.es/research/retinal-imaging/rim-one/	打开	是
RIM-ONE-r2	http://medimrg.webs.ull.es/research/retinal-imaging/rim-one/	打开	是
RIM-ONE-r3	http://medimrg.webs.ull.es/research/retinal-imaging/rim-one/	打开	是
RIM-ONE-DL	http://medimrg.webs.ull.es/research/retinal-imaging/rim-one/	打开	是
SIGF	https://github.com/XiaofeiWang2018/DeepGF	要求	是
SMDG	https://www.kaggle.com/datasets/deathtrooper/multichannel-glaucoma-benchmark-dataset	登记	是
sjchoi86-HRF	https://github.com/yiweichen04/retina_dataset	打开	是
威瑞克	https://github.com/ProfMKD/Glaucoma-dataset	打开	是