弹性纤维

欢迎使用 elastix：用于图像刚性和非刚性配准的工具箱。

elastix 是开源软件，基于著名的 Insight Segmentation and Registration Toolkit (ITK)。该软件由一组常用于执行（医学）图像配准的算法组成：通过优化相关图像相似性度量，找到空间变换、将一个图像（固定图像）映射到另一个图像（移动图像）的任务。 elastix的模块化设计允许用户针对特定应用快速配置、测试和比较不同的注册方法。命令行界面可以通过脚本自动处理大量数据集。如今，elastix 与 ITKElastix 一起提供了 Python（在 Pypi 上）版本，而 SimpleElastix 则提供了 C++、Python、Java、R、Ruby、C# 和 Lua 等语言版本。 dockerhub 上也提供了最新 elastix 版本的 docker 镜像。对于那些希望在图形用户界面中使用 elastix 功能的人来说，有几个插件可供使用，其中包括 napar 和 3Dslicer 插件。

作者

elastix 的主要开发人员是 Stefan Klein 和 Marius Staring。该软件最初是在 Josien PW Pluim 的监督下在图像科学研究所开发的。如今，许多人都为 elastix 做出了贡献。

如果您在任何地方使用该软件，如果您引用以下文章，我们将不胜感激：

• S. Klein、M. Staring、K. Murphy、MA Viergever、JPW Pluim，“elastix：基于强度的医学图像配准工具箱”，IEEE 医学成像交易，卷。 29、没有。 1，第 196 - 205 页，2010 年 1 月。下载 doi
• DP Shamonin、EE Bron、BPF Lelieveldt、M. Smits、S. Klein 和 M. Staring，“用于阿尔茨海默病诊断分类的 CPU 和 GPU 上的快速并行图像配准”，神经信息学前沿，卷。 7、没有。 50，第 1-15 页，2014 年 1 月。下载 doi

elastix的具体成分由多种成分组成；相关引用可以在这里找到。此外，您可以使用 Zenodo 的 elastix DOI 标识符来引用特定的软件版本：https://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.13366181

更多信息

更多信息，包括详尽的手册和模型动物园，可以在维基上找到

Jupyter 笔记本中提供了交互式教程。

您还可以订阅邮件列表来提问。有关为elastix做出贡献的信息可以在此处找到。