木兰
1.0.0
欢迎来到 scMulan_v1 存储库,其中包含我们即将推出的工作:“scMulan:用于单细胞分析的多任务生成预训练语言模型”。
scMulan 是用于分析单细胞转录组学的突破性基础模型。
特征:
conda create -n scMulan python==3.10
conda activate scMulan
pip install -r requirements.txt
下载ckpt文件并将其放在./ckpt/下
准备好测试数据文件,然后开始使用 scMulan
我们提供了使用 scMulan 进行细胞类型注释的教程(请参阅教程)。目前,scMulan 支持对心脏、肺、肝脏、骨髓、血液、大脑和胸腺等七个器官中的人类细胞类型进行零样本注释。
它还可用于获取用于批量集成的单元嵌入(请参阅教程)。您可以轻松使用您的数据并从 scMulan 获取分析。
scMulan 现在支持 NPU 上的推理。