RAPD

RAPD

注意 - 该项目正在开发中并且处于前沿。代码应该会在 2021 年 6 月显着稳定。

用于大分子晶体学数据的自动索引、策略、集成、分析和结构解决方案的软件包。

目前，我们正在构建命令行功能并向软件添加检测器。

当前命令：

• 分析 - 分析 MX 数据集并执行 pdbquery
• get_cif - 通过 4 字符代码从 PDB 获取 CIF 文件
• get_pdb - 通过 4 字符代码从 PDB 获取 PDB 文件
• hdf5_to_cbf - 将 hdf5 文件转换为 CBF
• index - 索引 MX 数据并计算数据收集策略
• 集成 - 集成 MX 数据
• pdbquery - 将数据与输入结构、常见污染物或 PDB 中具有相似晶胞参数的结构进行比较

开发者命令：

• 生成 - 创建新的 RAPD 模板文件
• print_ detector - 打印图像文件信息
• python - 具有完整 RAPD 导入功能的 python CLI
• test - RAPD 项目的测试运行程序
• version - 打印当前安装的 RAPD 版本
• xds_to_dict - 将 XDS.INP 转换为 python 字典以包含在 RAPD 检测器文件中

当前支持的站点检测器（更多即将推出）：

• APS

  • aps_gmca_dectris_eiger16m
  • lscat_dectris_eiger9m
  • lscat_rayonix_mx300
  • necat_dectris_eiger16m
  • necat_dectris_pilatus6mf
  • sercat_rayonix_mx300hs

• 加州大学洛杉矶分校

  • ucla_rigaku_raxisivpp

有关安装和设置的说明，请参阅 install/README.md