lyprox

什么是lyprox ？

它是一款 Django Web 应用程序，可显示头颈癌淋巴转移的详细模式，并允许人们更详细地探索底层数据集。它托管在 URL https://lyprox.org 下。

动机

HNSCC 通过颈部淋巴系统扩散，并在区域淋巴结中形成转移。肉眼可见的转移可以通过 MRI、PET 和 CT 扫描等成像方式检测到。当选择放疗作为治疗的一部分时，它们就会被包含在目标体积中。然而，显微转移太小，无法用当前的成像技术进行诊断。

为了解释这种微观受累，通常选择性地照射部分淋巴系统以增强肿瘤控制。目前，哪些部分包含在该选择性临床目标体积中是根据指南^{1 2 3 4}决定的。这些又源自每个淋巴结水平（LNL）的受累患病率的报告，即在任何给定的 LNL 中诊断出转移的患者部分，按原发肿瘤位置分层。如果 10 - 15% 的患者表现出参与该特定水平，建议将 LNL 纳入选择性目标体积中。

然而，虽然文献中已经报道了受累的发生率^{5 6} ，并且一般的淋巴引流途径也得到了很好的了解，但 HNSCC 的详细进展模式仍然缺乏量化。我们认为，LNL 中微观受累的风险在很大程度上取决于特定患者的具体诊断，因此如果能够更好地量化进展模式，则可以对他们的治疗进行个性化。

我们的目标

通过该界面，我们的主要目标是使提取的数据集易于访问。通过交互式可视化，人们可以非常快速地测试或提出有关 HNSCC 淋巴扩散的假设。希望这反过来能激励其他研究人员研究这些假设，提取并分享更多类似细节的数据。

反过来，这将使我们（或任何人，实际上）能够建立更准确和精确的肿瘤进展模型。例如，就像之前使用贝叶斯网络来预测个性化参与概率的工作⁷或我们最近在这个问题上使用隐马尔可夫模型发表的文章，从而引入了一种显式的时间建模方法⁸ 。

淋巴进展模式数据集

该界面中可视化的数据独立存在于一个开源存储库中：lyDATA。

我们还在Raditherapy & Oncology ⁹中发表了一篇关于数据集和接口的论文，预印本可在medRxiv ¹⁰上获取。

个性化 CTV 定义的概率模型

我们还研究可预测头颈癌淋巴扩散的概率模型^{7 8} 。底层代码托管在另一个存储库中：lymph。

如何贡献

您可以通过两种方式为该项目做出贡献：

1. 如果您是该领域的临床研究人员并希望与我们分享您的数据，请通过电子邮件与我们联系：[email protected]。
2. 另一种方法是为该存储库做出贡献，例如，如果您是软件开发人员。我想这有点不太可能，因为这个 Django 应用程序的范围非常具体，但我们仍然欢迎任何贡献。在这种情况下，可以在 GitHub 页面上找到源代码的详细文档。

本地运行该接口

如果您想自行托管数据或尝试数据在 Web 应用程序中的显示效果而无需上传，请随时按照这些说明在本地计算机上启动并运行数据。

脚注

1. Vincent Grégoire 等人，头颈适形放射治疗中淋巴结靶区的选择和描绘。基于手术经验的术语和程序标准化提案，放射治疗和肿瘤学，卷。 56，第 135-150 页，2000 年，doi：https://doi.org/10.1016/S0167-8140(00)00202-4。 ↩

2. Vincent Grégoire、A. Eisbruch、M. Hamoir 和 P. Levendag，关于在淋巴结阳性和术后颈部描绘淋巴结 CTV 的提案，放射治疗和肿瘤学，卷。 79，没有。 1，第 15-20 页，2006 年 4 月，doi：https://doi.org/10.1016/j.radonc.2006.03.009。 ↩

3. Vincent Grégoire 等人，头颈肿瘤颈部淋巴结水平的划分：2013 年更新。 DAHANCA、EORTC、HKNPCSG、NCIC CTG、NCRI、RTOG、TROG 共识指南，放射治疗和肿瘤学，卷。 110，不。 1，第 172-181 页，2014 年 1 月，doi：https://doi.org/10.1016/j.radonc.2013.10.010。 ↩

4. Julian Biau 等人，明确头颈放射治疗的淋巴结靶区选择：2019 年更新，放射治疗和肿瘤学，卷。 134，第 1-9 页，2019 年 5 月，doi：https://doi.org/10.1016/j.radonc.2019.01.018。 ↩

5. 贾廷。 P. Shah、FC Candela 和 AK Poddar，口腔鳞状细胞癌颈部淋巴结转移的模式，癌症，卷。 66，没有。 1，第 109-113 页，1990 年，doi：https://doi.org/10.1002/1097-0142(19900701)66:1%3C109::AID-CNCR2820660120%3E3.0.CO;2-A。 ↩

6. Laurence Bauwens 等人， HPV 阳性和 HPV 阴性口咽鳞状细胞癌中颈部淋巴结转移的患病率和分布，放射治疗和肿瘤学，卷。 157，第 122-129 页，2021 年 4 月，doi：https://doi.org/10.1016/j.radonc.2021.01.028。 ↩

7. Bertrand Pouymayou、P. Balermpas、O. Riesterer、M. Guckenberger 和 J. Unkelbach，用于头颈癌个性化选择性 CTV 定义的淋巴肿瘤进展贝叶斯网络模型，医学与生物学物理学，卷。 64，没有。 16，p。 165003，2019 年 8 月，doi：https://doi.org/10.1088/1361-6560/ab2a18。 ↩ ↩ ²

8. Roman Ludwig、B. Pouymayou、P. Balermpas 和 J. Unkelbach，头颈部淋巴肿瘤进展的隐马尔可夫模型， Sci Rep ，卷。 11、没有。 1，p。 12261，2021 年 12 月，doi：https://doi.org/10.1038/s41598-021-91544-1。 ↩ ↩ ²

9. Roman Ludwig 等人，通过在线界面详细报告口咽鳞状细胞癌淋巴结受累情况，放射治疗和肿瘤学，2022 年 2 月，doi：https://doi.org/10.1016/j.radonc.2022.01 .035. ↩

10. 罗曼·路德维希，J.-M. Hoffmann, B. Pouymayou 等人，通过在线界面详细报告口咽鳞状细胞癌淋巴结受累的患者个体， medRxiv ，2021 年 12 月。doi：https://doi.org/10.1101/2021.12.01.21267001。 ↩