这是用于R套件的存储库,其中包含用于跟踪动物的GPS和加速度计数据的数据管理和可视化工具(例如,母牛)。包括两个闪亮的应用程序来可视化和分析相关的时空数据。
请参阅PDF手册以获取有关功能使用情况的详细信息。
包括演示数据的动物追踪器应用程序船。或者,便捷地将您自己的.csv或.txt动物数据文件上传到zip文件夹中。在上传文件后,该应用程序可以选择过滤不良数据点。您可以使用Kalman聚类算法配置过滤参数和聚类。
默认情况下,高程查找是由解析上传数据确定的最大/最小纬度和经度的界限,但是可以手动修改边界。这些界限还影响了从过滤菜单中的Kalman聚类。同样,缩放级别默认为当前地图缩放,但也可以手动更改为1-14的值。单击复选框以包括坡度和高程方面。
使用下拉列表选择逐场,动物或日期范围进行过滤。应用功能将根据您的选择动态更新,并且已过滤数据也可以作为下载提供。
此外,动物追踪器可以从动物数据中可视化地形。在点和热图视图之间切换,或两者都覆盖。绘制矩形以选择特定区域。
动物追踪器还可以想象并比较您的动物行为。图包括动物随时间的升高以及动物样本中的点数以及动物的旅行率以及按位置花费的总时间(未显示)。
该应用程序带有统计摘要实用程序,可以补充可视化。在高程,GPS测量之间的时间差,课程,GPS测量之间的课程差,距离和总结速率之间进行选择。然后,从样本量,平均值,中位数,标准偏差,方差,最小值,最大值,范围,四分位数,第一四分位数和第三四分位数统计数据中进行选择。
用验证应用程序比较和可视化两个数据集。使用随附的演示数据集尝试使用该应用程序,或上传您自己的.CSV文件(尚未支持.txt)。
也可以应用离群值检测。目前,根据Iglewicz和Hoaglin(1993),我们支持修改的Z分类分类。
此外,从应用程序的离群值检测或已上传之前已应用于数据的方法提供了标记数据的摘要统计信息。
可以安装此应用程序并通过RSTUDIO(或基本R控制台)运行。
在安装动物跟踪器之前,请确保您安装并加载了DevTools软件包:
install.packages("devtools")
library(devtools)
通过运行以下操作安装和加载动物轨迹:
install_github("mathedjoe/animaltracker")
library(animaltracker)
通过运行以下内容启动核心闪亮应用程序:
run_shiny_animaltracker()
通过运行以下内容启动验证闪亮应用程序:
run_validation_app()
发送电子邮件至[email protected]。